1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
gtgagccttgacttctccacaccagtttaatccgaggccaagtgtggtgtgtgacagGATTACTTCATATGTGATGGAGACGTGATATGGGATGGGGAGTACCTCGACTTCGTAGGAGTGAACGACAAGGGCCTGAGAGTACTAGACCATTCCAAGA
species | Selaginella moellendorffii |
transcript | EFJ09297 |
intron # | 6 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CGATAATGGGTGTGGAGCGCAGCTCCATGCAGCCCATCTTCCATGTGGAG GATTACTTCATATGTGATGGAGACGTGATATGGGATGGGGAGTACCTCGACEST: gi|169080517|gb|FE490509.1|FE490509
genomic: CGATAATGGGTGTGGAGCGCAGCTCCATGCAGCCCATCTTCCATGTGGAGgtgagccttg ... tgtgtgacagGATTACTTCATATGTGATGGAGACGTGATATGGGATGGGGAGTACCTCGAC
EST: CGATAATGGGTGTGGAGCGCAGCTCCATGCAGCCCATCTTCCATGTGGAG GATTACTTCATATGTGATGGAGACGTGATATGGGATGGGGAGTACCTCGACEST: gi|169060106|gb|FE468092.1|FE468092
genomic: CGATAATGGGTGTGGAGCGCAGCTCCATGCAGCCCATCTTCCATGTGGAGgtgagccttg ... tgtgtgacagGATTACTTCATATGTGATGGAGACGTGATATGGGATGGGGAGTACCTCGAC
EST: CGATAATGGGTGTGGAGCGCAGCTCCATGCAGCCCATCTTCCATGTGGAG GATTACTTCATATGTGATGGAGACGTGATATGGGATGGGGAGTACCTCGAC
genomic: CGATAATGGGTGTGGAGCGCAGCTCCATGCAGCCCATCTTCCATGTGGAGgtgagccttg ... tgtgtgacagGATTACTTCATATGTGATGGAGACGTGATATGGGATGGGGAGTACCTCGAC
gagccttgacttctccacaccagtttaatccgaggccaagtgtggtgtgtgacagGATTACTTCATATGTGATGGAGACGTGATATGGGATGGGGAGTACCTCGACTTCGTAGGAGTGAACGACAAGGGCCTGAGAGTACTAGACCATTCCAAGA
gtttaat putative branch site (score: 16)
agtttaat TA-rich tract