1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
gtaagtcgatcatgattctcacggcaccactttgcttgatcctacgatatcattccatcgattccctcctttttctttcctgttcttcctgctcagatcaaatcattcccttccggatcaaatcaagttttttcttacttctttttgcaagaccagatgatatagctaagtttgtggttttcttgcagAGAAATCATGCATGCTATGTGGAAGCCTTCAAAGTTTAAGTCAGTTTACCTCTTCTCAACCTTGTATGTGCTCACCTTGACAATACCATCTGCTACAGCC
species | Selaginella moellendorffii |
transcript | EFJ36050 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TACACCTTTGGTGGTCATGCCGTCACTGT AGAAATCATGCATGCTATGTGGAAGCCTTCAAAG-TTAAGTCAGNTTTACC
genomic: TACACCTTTGGTGGTCATGCCGTCACTGTgtaagtcgat ... tttcttgcagAGAAATCATGCATGCTATGTGGAAGCCTTCAAAGTTTAAGTCAG-TTTACC
cttacttctttttgcaagaccagatgatatagctaagtttgtggttttcttgcagAGAAATCATGCATGCTATGTGGAAGCCTTCAAAGTTTAAGTCAGTTTACCTCTTCTCAACCTTGTATGTGCTCACCTTGACAATACCATCTGCTACAGCC
ttcttac putative branch site (score: 10)
ttttcttgc putative PPT
ttcttttt TA-rich tract