1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
gtaagcttttctctgccaaaaaacttcaatccttttaatctcttttcacagGGAATGGCCGCTGGTCATGTCTACTACTTCCTCGAGGACGTCTATCCTCAAATGACGGGCCGGAGAGTGCTCAAAACTCCCGGTTTGATCAAAGCGTTGT
species | Selaginella moellendorffii |
transcript | EFJ25138 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TCCTTGGCTTCTCTGTAATGGTGGGAAGCAGCCCCTGGGTCGATCTCCTC GGAATGGCCGCTGGTCATGTCTACTACTTCCTCGAGGACGTCTATCCTCAAEST: gi|169044530|gb|FE451115.1|FE451115
genomic: TCCTTGGCTTCTCTGTAATGGTGGGAAGCAGCCCCTGGGTCGATCTCCTCgtaagctttt ... cttttcacagGGAATGGCCGCTGGTCATGTCTACTACTTCCTCGAGGACGTCTATCCTCAA
EST: TCCTTGGCTTCTCTGTAATGGTGGGAAGCAGCCCCTGGGTCGATCTCCTC GGAATGGCCGCTGGTCATGTCTACTACTTCCTCGAGEST: gi|169064365|gb|FE472032.1|FE472032
genomic: TCCTTGGCTTCTCTGTAATGGTGGGAAGCAGCCCCTGGGTCGATCTCCTCgtaagctttt ... cttttcacagGGAATGGCCGCTGGTCATGTCTACTACTTCCTCGAG
EST: TCCTTGGCTTCTCTGTAATGGTGGGAAGCAGCCCCTGGGTCGATCTCCTC GGAATGGCCGCTGGTCATGTCTACTACTTCCTCGAGGACGTCTATCCTCAAEST: gi|169039143|gb|FE448298.1|FE448298
genomic: TCCTTGGCTTCTCTGTAATGGTGGGAAGCAGCCCCTGGGTCGATCTCCTCgtaagctttt ... cttttcacagGGAATGGCCGCTGGTCATGTCTACTACTTCCTCGAGGACGTCTATCCTCAA
EST: TCCTTGGCTTCTCTGTAATGGTGGGAAGCAGCCCCTGGGTCGATCTCCTC GGAATGGCCGCTGGTCATGTCTACTACTTCCTCGAGGACGTCTATCCTCAN
genomic: TCCTTGGCTTCTCTGTAATGGTGGGAAGCAGCCCCTGGGTCGATCTCCTCgtaagctttt ... cttttcacagGGAATGGCCGCTGGTCATGTCTACTACTTCCTCGAGGACGTCTATCCTCAA
gtaagcttttctctgccaaaaaacttcaatccttttaatctcttttcacagGGAATGGCCGCTGGTCATGTCTACTACTTCCTCGAGGACGTCTATCCTCAAATGACGGGCCGGAGAGTGCTCAAAACTCCCGGTTTGATCAAAGCGTTGT
ttttaat putative branch site (score: 10)
tccttttaatctcttt CT-rich tract
ttttaatctctttt TA-rich tract