1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
gtaagattaacgtcatcctttctccgttgtaattgctgctaacggaagtgttgttttgctctcagATCTCAGGGATGACAAGCACTTCTTTAACGATCATCCGGGTGCTACAGCTATTACCACTGCACAG
species | Selaginella moellendorffii |
transcript | EFJ11645 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GAGACATTATGCTTCTACCGTGCCTGTCATCCTTGTGGGTACAAAGCTGG ATCTCAGGGATGACAAGCACTTCTTTAACGATCATCCGGGTGCTACAGCTAEST: gi|169057947|gb|FE465545.1|FE465545
genomic: GAGACATTATGCTTCTACCGTGCCTGTCATCCTTGTGGGTACAAAGCTGGgtaagattaa ... ttgctctcagATCTCAGGGATGACAAGCACTTCTTTAACGATCATCCGGGTGCTACAGCTA
EST: GAGACATTATGCTTCTACCGTGCCTGTCATCCTTGTGGGTACAAAGCTGG ATCTCAGGGATGACAAGCACTTCTTTAACGATCATCCGGGTGCTACAGCTAEST: gi|169034528|gb|FE444575.1|FE444575
genomic: GAGACATTATGCTTCTACCGTGCCTGTCATCCTTGTGGGTACAAAGCTGGgtaagattaa ... ttgctctcagATCTCAGGGATGACAAGCACTTCTTTAACGATCATCCGGGTGCTACAGCTA
EST: GAGACATTATGCTTCTACCGTGCCTGTCATCCTTGTGGGTACAAAGCTGG ATCTCAGGGATGACAAGCACTTCTTTAACGATCATCCGGGTGCTACAGCTAEST: gi|169037117|gb|FE444402.1|FE444402
genomic: GAGACATTATGCTTCTACCGTGCCTGTCATCCTTGTGGGTACAAAGCTGGgtaagattaa ... ttgctctcagATCTCAGGGATGACAAGCACTTCTTTAACGATCATCCGGGTGCTACAGCTA
EST: GAGACATTATGCTTCTACCGTGCCTGTCATCCTTGTGGGTACAAAGCTGG ATCTCAGGGATGACAAGCACTTCTTTAACGATCATCCGGGTGCTACAGCTAEST: gi|169058887|gb|FE467694.1|FE467694
genomic: GAGACATTATGCTTCTACCGTGCCTGTCATCCTTGTGGGTACAAAGCTGGgtaagattaa ... ttgctctcagATCTCAGGGATGACAAGCACTTCTTTAACGATCATCCGGGTGCTACAGCTA
EST: GAGACATTATGCTTCTACCGTGCCTGTCATCCTTGTGGGTACAAAGCTGG ATTTCAGGGATGACAAGCACTTCTTTAACGATCATCCGGGTGCTACAGCTA
genomic: GAGACATTATGCTTCTACCGTGCCTGTCATCCTTGTGGGTACAAAGCTGGgtaagattaa ... ttgctctcagATCTCAGGGATGACAAGCACTTCTTTAACGATCATCCGGGTGCTACAGCTA
cgtcatcctttctccgttgtaattgctgctaacggaagtgttgttttgctctcagATCTCAGGGATGACAAGCACTTCTTTAACGATCATCCGGGTGCTACAGCTATTACCACTGCACAG
tgctaac putative branch site (score: 11)
ttttgctctc putative PPT
ttgtaatt TA-rich tract