1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
gtaaagttcctggatttttttaaaaggtttctctcttaaagtcttacgcgtttctccagGCTCGGGACTACACACGTTCGTGCTCTACCTTGGTCCTCACATTGCCATGTTTACGCTCAAAGCCACCCTCTGTGGACGCGACGACTTAAAGTCCGCGCC
species | Selaginella moellendorffii |
transcript | EFJ15115 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTTCGCTGTATGGTGGATCGGCCTTGGAGTGGCTTCTTCGATCGGACTCG GCTCGGGACTACACACGTTCGTGCTCTACCTTGGTCCTCACATTGCCATGTEST: gi|169051285|gb|FE457622.1|FE457622
genomic: TTTCGCTGTATGGTGGATCGGCCTTGGAGTGGCTTCTTCGATCGGACTCGgtaaagttcc ... gtttctccagGCTCGGGACTACACACGTTCGTGCTCTACCTTGGTCCTCACATTGCCATGT
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agttcctggatttttttaaaaggtttctctcttaaagtcttacgcgtttctccagGCTCGGGACTACACACGTTCGTGCTCTACCTTGGTCCTCACATTGCCATGTTTACGCTCAAAGCCACCCTCTGTGGACGCGACGACTTAAAGTCCGCGCC
gtcttac putative branch site (score: 15)
cgtttctcc CT-rich tract
atttttttaaaaggtt TA-rich tract