Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   		18  
 5'  3'   		19  
 5'  3'   		20  
 5'  3'   
21  
 5'  3'   		22  
 5'  3'   		23  
 5'  3'   		24  
 5'  3'   		25  
 5'  3'   		26  
 5'  3'   		27  
 5'  3'   		28  
 5'  3'   		29  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtaaactctttttctacgaagttacttttcccattctccgtgcagCATAGGAAGATGCATGATTCCTTGGGTGGAGCTTTACCAATGCAAACACCGGAAAGCGAAGGTGCATACTCACCCAAATACTCTGATACGCTGTCGCCCG

Basic information

species Selaginella moellendorffii
transcript EFJ04870
intron # 23
splice site 3'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|169099787|gb|FE500792.1|FE500792
EST:     GTACGAGACTTTTCTTTAAACTTATGGAAGAATGTCTCTCCCTCTTTGAG                         CATAGGAAGATGCATGATTCCTTGGGTGGAGCTTTACCAATGCAAACACCG
genomic: GTACGAGACTTTTCTTTAAACTTATGGAAGAATGTCTCTCCCTCTTTGAGgtaaactctt ... ctccgtgcagCATAGGAAGATGCATGATTCCTTGGGTGGAGCTTTACCAATGCAAACACCG






















 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

gtaaactctttttctacgaagttacttttcccattctccgtgcagCATAGGAAGATGCATGATTCCTTGGGTGGAGCTTTACCAATGCAAACACCGGAAAGCGAAGGTGCATACTCACCCAAATACTCTGATACGCTGTCGCCCG
                                        ttacttttcccattct  CT-rich tract
                  tttttcta  TA-rich tract