Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   
2  
 5'  3'   
3  
 5'  3'   
4  
 5'  3'   
5  
 5'  3'   
6  
 5'  3'   
7  
 5'  3'   
8  
 5'  3'   
9  
 5'  3'   
10  
 5'  3'   
11  
 5'  3'   
12  
 5'  3'   
13  
 5'  3'   
14  
 5'  3'   
15  
 5'  3'   
16  
 5'  3'   
17  
 5'  3'   
18  
 5'  3'   
19  
 5'  3'   
20  
 5'  3'   
21  
 5'  3'   
22  
 5'  3'   
23  
 5'  3'   
24  
 5'  3'   
25  
 5'  3'   
26  
 5'  3'   
27  
 5'  3'   
28  
 5'  3'   
29  
 5'  3'   
30  
 5'  3'   
31  
 5'  3'   
32  
 5'  3'   
33  
 5'  3'   
34  
 5'  3'   
35  
 5'  3'   
36  
 5'  3'   
37  
 5'  3'   
38  
 5'  3'   
39  
 5'  3'   
40  
 5'  3'   
41  
 5'  3'   
42  
 5'  3'   
43  
 5'  3'   
44  
 5'  3'   
45  
 5'  3'   
46  
 5'  3'   
47  
 5'  3'   
48  
 5'  3'   
49  
 5'  3'   
50  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtaaaattcatgactcgaatacaaattgtaatattttaattcagGTCACTGCACATGTGTCTTCTTTGCTACACCCGTTGTTGAGCGTTCTAGATGG

Basic information

species Selaginella moellendorffii
transcript EFJ26294
intron # 22
splice site 3'
intron type U2


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

gtaaaattcatgactcgaatacaaattgtaatattttaattcagGTCACTGCACATGTGTCTTCTTTGCTACACCCGTTGTTGAGCGTTCTAGATGG
                                            ttttaat  putative branch site (score: 3)
 aatacaaattgtaata  TA-rich tract