1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' | 17 5' 3' | 18 5' 3' |
gtaagccagtttcgttttgtttttgttttttcactactgacaagcttgtattagGGGCTGGCTGTCACCTACTGATGTGCTTCGCACCCAGCCACATCTCATGCTATTGGGTTCGGGTTTTGCGTTCGGGTACTTGGTG
species | Selaginella moellendorffii |
transcript | EFJ14843 |
intron # | 13 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CTGGTGCCGTTCTTTGTGCTTCTTGGAAGCATTGTGATATG GGGCTGGCTGTCACCTACTGATGTGCTTCGCACCCAGCCACATCTCATGCTEST: gi|169054409|gb|FE462102.1|FE462102
genomic: CTGGTGCCGTTCTTTGTGCTTCTTGGAAGCATTGTGATATGgtaagccagt ... cttgtattagGGGCTGGCTGTCACCTACTGATGTGCTTCGCACCCAGCCACATCTCATGCT
EST: CTGGTGCCGTTCTTTGTGCTTCTTGGAAGCATTGTGATATG GGGTTGGCTGTCACCTACTGATGTGCTTCGCACCCAGCCACATCTCATGCTEST: gi|169062984|gb|FE472942.1|FE472942
genomic: CTGGTGCCGTTCTTTGTGCTTCTTGGAAGCATTGTGATATGgtaagccagt ... cttgtattagGGGCTGGCTGTCACCTACTGATGTGCTTCGCACCCAGCCACATCTCATGCT
EST: CTGGTGCCGTTCTTTGTGCTTCTTGGAAGCATTGTGATATG GGGCTGGCTGTCACCTACTGATGTGCTTCGCACCCAGCCACATCTCATGCTEST: gi|169108716|gb|FE510515.1|FE510515
genomic: CTGGTGCCGTTCTTTGTGCTTCTTGGAAGCATTGTGATATGgtaagccagt ... cttgtattagGGGCTGGCTGTCACCTACTGATGTGCTTCGCACCCAGCCACATCTCATGCT
EST: CTGGTGCCGTTCTTTGTGCTTCTTGGAAGCATTGTGATATG GGGTTGGCTGTCACCTACTGATGTGCTTCGCACCCAGCCACATCTCATGCTEST: gi|169063658|gb|FE471764.1|FE471764
genomic: CTGGTGCCGTTCTTTGTGCTTCTTGGAAGCATTGTGATATGgtaagccagt ... cttgtattagGGGCTGGCTGTCACCTACTGATGTGCTTCGCACCCAGCCACATCTCATGCT
EST: CTGGTGCCGTTCTTTGTGCTTCTTGGAAGCATTGTGATATG GGGTTGGCTGTCACCTACTGATGTGCTTCGCACCCAGCCACATCTCATGCTEST: gi|169063659|gb|FE471765.1|FE471765
genomic: CTGGTGCCGTTCTTTGTGCTTCTTGGAAGCATTGTGATATGgtaagccagt ... cttgtattagGGGCTGGCTGTCACCTACTGATGTGCTTCGCACCCAGCCACATCTCATGCT
EST: CTGGTGCCGTTCTTTGTGCTTCTTGGAAGCATTGTGATATG GGGTTGGCTGTCACCTACTGATGTGCTTCGCACCCAGCCACATCTCATGCTEST: gi|169105269|gb|FE506371.1|FE506371
genomic: CTGGTGCCGTTCTTTGTGCTTCTTGGAAGCATTGTGATATGgtaagccagt ... cttgtattagGGGCTGGCTGTCACCTACTGATGTGCTTCGCACCCAGCCACATCTCATGCT
EST: CTGGTGCCGTTCTTTGTGCTTCTTGGAAGCATTGTGATATG GGGTTGGCTGTCACCTACTGATGTGCTTCGCACCCAGCCACATCTCATGCTEST: gi|169108715|gb|FE510514.1|FE510514
genomic: CTGGTGCCGTTCTTTGTGCTTCTTGGAAGCATTGTGATATGgtaagccagt ... cttgtattagGGGCTGGCTGTCACCTACTGATGTGCTTCGCACCCAGCCACATCTCATGCT
EST: CTGGTGCCGTTCTTTGTGCTTCTTGGAAGCATTGTGATATG GGGTTGGCTGTCACCTACTGATGTGCTTCGCACCCAGCCACATCTCATGCT
genomic: CTGGTGCCGTTCTTTGTGCTTCTTGGAAGCATTGTGATATGgtaagccagt ... cttgtattagGGGCTGGCTGTCACCTACTGATGTGCTTCGCACCCAGCCACATCTCATGCT
gtaagccagtttcgttttgtttttgttttttcactactgacaagcttgtattagGGGCTGGCTGTCACCTACTGATGTGCTTCGCACCCAGCCACATCTCATGCTATTGGGTTCGGGTTTTGCGTTCGGGTACTTGGTG
tactgac putative branch site (score: 8)
ttttgtttttgttttt TA-rich tract