1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' |
...gtgttctccttgttattacgaactggaagcatgtgcatcgcataggattttcctattttcaatcaaagtgaggtcttacatcgctcgctgttggactcagGTGTGTACGAATGCTGCTGTGGCAAGTCGGGTAGACAGTCAGTTAAAACTGGTCATCCGCCCCATGTACTCTAGCCCCCCGGCTCATGGTGCAGCCATTG
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S132_95V6.2 |
intron # | 9 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ATGCTAAGAACATGGGACTTTATGGAGAGCGAGTCGGTGCATTAAGCGTC GTGTGTACGAATGCTGCTGTGGCAAGTCGGGTAGACAGTCAGTTAAAACTGEST: gi|162173605|gb|FC349573.1|FC349573
genomic: ATGCTAAGAACATGGGACTTTATGGAGAGCGAGTCGGTGCATTAAGCGTCgtaagttctt ... ttggactcagGTGTGTACGAATGCTGCTGTGGCAAGTCGGGTAGACAGTCAGTTAAAACTG
EST: ATGCTAAGAACATGGGACTTTATGGAGAGCGAGTCGGTGCATTAAGCGTC GTGTGTACGAATGCTGCTGTGGCAAGTCGGGTAGACAGTCAGTTAAAACTGEST: gi|162182166|gb|FC358181.1|FC358181
genomic: ATGCTAAGAACATGGGACTTTATGGAGAGCGAGTCGGTGCATTAAGCGTCgtaagttctt ... ttggactcagGTGTGTACGAATGCTGCTGTGGCAAGTCGGGTAGACAGTCAGTTAAAACTG
EST: GACTTTATGGAGAGCGAGTCGGTGCATTAAGCGTC GTGTGTACGAATGCTGCTGTGGCAAGTCGGGTAGACAGTCAGTTAAAACTGEST: gi|67726923|gb|BJ977182.1|BJ977182
genomic: GACTTTATGGAGAGCGAGTCGGTGCATTAAGCGTCgtaagttctt ... ttggactcagGTGTGTACGAATGCTGCTGTGGCAAGTCGGGTAGACAGTCAGTTAAAACTG
EST: ATGCTAAGAACATGGGACTTTATGGAGAGCGAGTCGGTGCATTAAGCGTC GTGTGTACGAATGCTGCTGTGGCAAGTCGGGTAGACAGTCAGTTAAAACTGEST: gi|162196336|gb|FC375406.1|FC375406
genomic: ATGCTAAGAACATGGGACTTTATGGAGAGCGAGTCGGTGCATTAAGCGTCgtaagttctt ... ttggactcagGTGTGTACGAATGCTGCTGTGGCAAGTCGGGTAGACAGTCAGTTAAAACTG
EST: ATGCTAAGAACATGGGACTTTATGGAGAGCGAGTCGGTGCATTAAGCGTC GTGTGTACGAATGCTGCTGTGGCAAGTCGGGTAGACAGTCAGTTAAAACTGEST: gi|208400819|gb|DC925099.1|DC925099
genomic: ATGCTAAGAACATGGGACTTTATGGAGAGCGAGTCGGTGCATTAAGCGTCgtaagttctt ... ttggactcagGTGTGTACGAATGCTGCTGTGGCAAGTCGGGTAGACAGTCAGTTAAAACTG
EST: ATGCTAAGANCNTGGGACTTTATGGAGAGCGAGTCGGTGCATTAAGCGTC GTGTGTACGAATGCTGCTGTGGCAAGTCGGGTAGACAGTCAGTTAAAACTGEST: gi|162267155|gb|FC443386.1|FC443386
genomic: ATGCTAAGAACATGGGACTTTATGGAGAGCGAGTCGGTGCATTAAGCGTCgtaagttctt ... ttggactcagGTGTGTACGAATGCTGCTGTGGCAAGTCGGGTAGACAGTCAGTTAAAACTG
EST: ATGCTAAGAACATGGGACTTTATGGAGAGCGAGTCGGTGCATTAAGCGTC GTGTGTACGAATGCTGCTGTGGCAAGTCGGGTAGACAGTCAGTTAAAACTGEST: gi|208350485|gb|DC926452.1|DC926452
genomic: ATGCTAAGAACATGGGACTTTATGGAGAGCGAGTCGGTGCATTAAGCGTCgtaagttctt ... ttggactcagGTGTGTACGAATGCTGCTGTGGCAAGTCGGGTAGACAGTCAGTTAAAACTG
EST: ATGCTAAGAACATGGGACTTTATGGAGAGCGAGTCGNTGCATTAAGCGTC GTGTGTACGAATGCTGCTGTGGCAAGTCGGGTAGACAGTCAGTTAAAACTGEST: gi|162205457|gb|FC381555.1|FC381555
genomic: ATGCTAAGAACATGGGACTTTATGGAGAGCGAGTCGGTGCATTAAGCGTCgtaagttctt ... ttggactcagGTGTGTACGAATGCTGCTGTGGCAAGTCGGGTAGACAGTCAGTTAAAACTG
EST: ATGCTAAGAACATGGGACTTTATGGAGAGCGAGTCGGTGCATTNAGCGTC GTGTGTACGAATGCTGCTGTGGCAAGTCGGGTAGACAGTCAGTTAAAACTGEST: gi|208366377|gb|DC947573.1|DC947573
genomic: ATGCTAAGAACATGGGACTTTATGGAGAGCGAGTCGGTGCATTAAGCGTCgtaagttctt ... ttggactcagGTGTGTACGAATGCTGCTGTGGCAAGTCGGGTAGACAGTCAGTTAAAACTG
EST: ATGCTAAGAACATGGGACTTTATGGAGAGCGAGTCGGTGCATTAAGCGTC GTGTGTACGAATGCTGCTGTGGCAAGTCGGGTAGACAGTCAGTTAAAACTGEST: gi|162175651|gb|FC351238.1|FC351238
genomic: ATGCTAAGAACATGGGACTTTATGGAGAGCGAGTCGGTGCATTAAGCGTCgtaagttctt ... ttggactcagGTGTGTACGAATGCTGCTGTGGCAAGTCGGGTAGACAGTCAGTTAAAACTG
EST: ATGCTAAGAACATGAGACTTTATGGAGAGCGAGTCGGTGCATTAAGCGTC GTGTGTACGAATGCTGCTGTGGCAAGTCGGGTAGACAGTCAGTTAAAACTGEST: gi|162263808|gb|FC438427.1|FC438427
genomic: ATGCTAAGAACATGGGACTTTATGGAGAGCGAGTCGGTGCATTAAGCGTCgtaagttctt ... ttggactcagGTGTGTACGAATGCTGCTGTGGCAAGTCGGGTAGACAGTCAGTTAAAACTG
EST: ATGCTAAGAACATGGGACTTTATGGAGAGCGAGTCGGTGCATTAAGCGTC GTGTGTACGAATGCTGCTGTGGCAAGTCGGGTAGACAGTCAGTTAAAACTGEST: gi|162176138|gb|FC351087.1|FC351087
genomic: ATGCTAAGAACATGGGACTTTATGGAGAGCGAGTCGGTGCATTAAGCGTCgtaagttctt ... ttggactcagGTGTGTACGAATGCTGCTGTGGCAAGTCGGGTAGACAGTCAGTTAAAACTG
EST: ATGCTAAGAACATGGGACTTTATGGAGAGCGAGTCGGTGCATTAAGCGTC GTGTGTACGAATGCTGCTGTGGCAAGTCGGGTAGACAGTCAGTTAAAACTG
genomic: ATGCTAAGAACATGGGACTTTATGGAGAGCGAGTCGGTGCATTAAGCGTCgtaagttctt ... ttggactcagGTGTGTACGAATGCTGCTGTGGCAAGTCGGGTAGACAGTCAGTTAAAACTG
gattttcctattttcaatcaaagtgaggtcttacatcgctcgctgttggactcagGTGTGTACGAATGCTGCTGTGGCAAGTCGGGTAGACAGTCAGTTAAAACTGGTCATCCGCCCCATGTACTCTAGCCCCCCGGCTCATGGTGCAGCCATTG
gtcttac putative branch site (score: 3)
tattttcaatcaaa TA-rich tract