1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
...ctaactattatatgtttagttgctgtgtgatttatggaagagattggaaacttttttaaatatctgaccttgtttgttaataatcacattttgtttgcagACTTAAGGCGAGCCAGAGAGGAGTGCTGCTCGGATTTTCGTAGGCTTAATTCTACCGGTGAATCTACAAATAGTCATGGTACTGTGCAAAAATTGCATTC
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S73_26V6.1 |
intron # | 7 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ATCTGCGGCTGTTACGGCTTCGGCTGCTCAGTAACTAAGTCAGCTTAACG ACTTAAGGCGAGCCAGAGAGGAGTGCTGCTCGGATTTTCGTAGGCTTAATTEST: gi|37848477|gb|BJ606485.1|BJ606485
genomic: ATCTGCGGCTGTTACGGCTTCGGCTGCTCAGTAACTAAGTCAGCTTAACGgtaaactatg ... ttgtttgcagACTTAAGGCGAGCCAGAGAGGAGTGCTGCTCGGATTTTCGTAGGCTTAATT
EST: ATCTGCGGCTGTTACGGCTTCGGCTGCTCAGTAACTAAGTCAGCTTAACG ACTTAAGGCGAGCCAGAGAGGAGTGCTGCTCGGATTTTCGTAGGCTTAATTEST: gi|37849577|gb|BJ607585.1|BJ607585
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ggaaacttttttaaatatctgaccttgtttgttaataatcacattttgtttgcagACTTAAGGCGAGCCAGAGAGGAGTGCTGCTCGGATTTTCGTAGGCTTAATTCTACCGGTGAATCTACAAATAGTCATGGTACTGTGCAAAAATTGCATTC
tgttaat putative branch site (score: 3)
ttttgttt putative PPT
ttttttaaatatctga TA-rich tract