1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
gtatgacttctccttgcccatatatatatatatatatattcgtgtctgaaagttatatgagttgtgaaggctggaaataggtggaatttagcttaacattgtttgtactgggttggacgtgcagTGATGAGGAGCTACTTTGCCAAGGTTTAGCTTTGAATGATGAGCTGCAGAGAGTGCTCGCTAGATATGATGCTTTCTTGTCGGGGGCTCCCATACCCGAA
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S49_145V6.1 |
intron # | 7 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CAATGTCGACTGAATCAGCATCGGGTTATGCAACTCGTCAACATATCTTC TGATGAGGAGCTACTTTGCCAAGGTTTAGCTTTGAATGATGAGTTGCAGAGEST: gi|162198219|gb|FC375496.1|FC375496
genomic: CAATGTCGACTGAATCAGCATCGGGTTATGCAACTCGTCAACATATCTTCgtatgacttc ... ggacgtgcagTGATGAGGAGCTACTTTGCCAAGGTTTAGCTTTGAATGATGAGCTGCAGAG
EST: CAATGTCGACTGAATCAGCATCGGGTTATGCAACTCGTCAACATATCTTC TGATGAGGAGCTACTTTGCCAAGGTTTAGCTTTGAATGATGAGTTGCAGAGEST: gi|162176357|gb|FC353542.1|FC353542
genomic: CAATGTCGACTGAATCAGCATCGGGTTATGCAACTCGTCAACATATCTTCgtatgacttc ... ggacgtgcagTGATGAGGAGCTACTTTGCCAAGGTTTAGCTTTGAATGATGAGCTGCAGAG
EST: CAATGTCGACTGAATCAGCATCGGGTTATGCAACTCGTCAACATATCTTC TGATGAGGAGCTACTTTGCCAAGGTTTAGCTTTGAATGATGAGTTGCAGAGEST: gi|162181861|gb|FC357668.1|FC357668
genomic: CAATGTCGACTGAATCAGCATCGGGTTATGCAACTCGTCAACATATCTTCgtatgacttc ... ggacgtgcagTGATGAGGAGCTACTTTGCCAAGGTTTAGCTTTGAATGATGAGCTGCAGAG
EST: ACTCGTC-ACATATCTTC TGATGAGGAGCTACTTTGCCAAGGTTTAGCTTTGAATGATGAGTTGCAGAG
genomic: ACTCGTCAACATATCTTCgtatgacttc ... ggacgtgcagTGATGAGGAGCTACTTTGCCAAGGTTTAGCTTTGAATGATGAGCTGCAGAG
gctggaaataggtggaatttagcttaacattgtttgtactgggttggacgtgcagTGATGAGGAGCTACTTTGCCAAGGTTTAGCTTTGAATGATGAGCTGCAGAGAGTGCTCGCTAGATATGATGCTTTCTTGTCGGGGGCTCCCATACCCGAA
gcttaac putative branch site (score: 16)
ttaacatt TA-rich tract