1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
gtaagctctgttctgggtgttagcagtctcgtcagatatgtttcttgggggccacctgcattggcttgatgtaaaattgtatctttttattttttgtagcattcgccaactggagctgttgtgtggggaccgctgatcatattaagcccatggtatgtttattcatcgatgtgtgcatgtgttgatgtggtaccagGCTGTTCCTCATGTTGAGGCGGTTCCCTATCGAATCGAAGGGCCGCCGAAAGAAACTTCGCGAGGTTGGGTGTGTGACGGCTATTTGTTTCATATGCTTC
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S295_28V6.1 |
intron # | 7 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTGTTTCGCTTGTGGCCGCGCTGGGATTCATAATATATGGTGGAAG GCTGTTCCTCATGTTGAGGCGGTTCCCTATCGAATCGAAGGGCCGCCGAAAEST: gi|67724795|gb|BJ975054.1|BJ975054
genomic: TTGTTTCGCTTGTGGCCGCGCTGGGATTCATAATATATGGTGGAAGgtaagctctg ... gtggtaccagGCTGTTCCTCATGTTGAGGCGGTTCCCTATCGAATCGAAGGGCCGCCGAAA
EST: TTGTTTCGCTTGTGGCCGCGCTGGGATTCATAATATATGGTGGAAG GCTGTTCCTCATGTTGAGGCGGTTCCCTATCGAATCGAAGGGCCGCCGAAAEST: gi|67508414|gb|BJ941281.1|BJ941281
genomic: TTGTTTCGCTTGTGGCCGCGCTGGGATTCATAATATATGGTGGAAGgtaagctctg ... gtggtaccagGCTGTTCCTCATGTTGAGGCGGTTCCCTATCGAATCGAAGGGCCGCCGAAA
EST: TTGTTTCGCTTGTGGCCGCGCTGGGATTCATAATATATGGTGGAAN GCTGTTCCTCA
genomic: TTGTTTCGCTTGTGGCCGCGCTGGGATTCATAATATATGGTGGAAGgtaagctctg ... gtggtaccagGCTGTTCCTCA
ttaagcccatggtatgtttattcatcgatgtgtgcatgtgttgatgtggtaccagGCTGTTCCTCATGTTGAGGCGGTTCCCTATCGAATCGAAGGGCCGCCGAAAGAAACTTCGCGAGGTTGGGTGTGTGACGGCTATTTGTTTCATATGCTTC
tgttgat putative branch site (score: 8)
tatgtttatt TA-rich tract