1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' |
...atatcagtcttagcttcccttactatgcatgtgttgatatggacttttgacgagttgatgtgttcatcttaagttgacgaagtgagtaatttttcaacagAGCTCCGATTGGCCAGGGTTATGGCTTGACCGAGACTTGTGCTGGTGCGACGTTTAGTGAATGGGATGACACTTCTGTTGGACGTGTTGGACCTCCTGTA
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S186_65V6.1 |
intron # | 7 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GGTGCTCCACTATCTCCGGATACTCAGCGTTTCATCAATGTCTGCTTCGG AGCTCCGATTGGCCAGGGTTATGGCTTGACCGAGACTTGTGCTGGTGCGACEST: gi|100385385|gb|BY950977.1|BY950977
genomic: GGTGCTCCACTATCTCCGGATACTCAGCGTTTCATCAATGTCTGCTTCGGgtaatagttt ... ttttcaacagAGCTCCGATTGGCCAGGGTTATGGCTTGACCGAGACTTGTGCTGGTGCGAC
EST: GGTGCTCCACTATCTCCGGATACTCAGCGTTTCATCAATGTCTGCTTCGG AGCTCCGATTGGCCAGGGTTATGGCTTGACCGAGACTTGTGCTGGTGCGACEST: gi|162196325|gb|FC374368.1|FC374368
genomic: GGTGCTCCACTATCTCCGGATACTCAGCGTTTCATCAATGTCTGCTTCGGgtaatagttt ... ttttcaacagAGCTCCGATTGGCCAGGGTTATGGCTTGACCGAGACTTGTGCTGGTGCGAC
EST: GGTGCTCCACTATCTCCGGATACTCAGCGTTTCATCAATGTCTGCTTCGG AGCTCCGATTGGCCAGGGTTATGGCTTGACCGAGACTTGTGCTGGTGCGACEST: gi|162273457|gb|FC449906.1|FC449906
genomic: GGTGCTCCACTATCTCCGGATACTCAGCGTTTCATCAATGTCTGCTTCGGgtaatagttt ... ttttcaacagAGCTCCGATTGGCCAGGGTTATGGCTTGACCGAGACTTGTGCTGGTGCGAC
EST: GGTGCTCCACTATCTCCGGATACTCAGCGTTTCATCAATGTCTGCTTCGG AGCTCCGATTGGCCAGGGTTATGGCTTGACCGAGACTTGTGCTGGTGCGACEST: gi|162188839|gb|FC364853.1|FC364853
genomic: GGTGCTCCACTATCTCCGGATACTCAGCGTTTCATCAATGTCTGCTTCGGgtaatagttt ... ttttcaacagAGCTCCGATTGGCCAGGGTTATGGCTTGACCGAGACTTGTGCTGGTGCGAC
EST: GGTGCTCCACTATCTCCGGATACTCAGCGTTTCATCAATGTCTGCTTCGG AGCTCCGATTGGCCAGGGTTATGGCTTGACCGAGACTTGTGCTGGTGCGAC
genomic: GGTGCTCCACTATCTCCGGATACTCAGCGTTTCATCAATGTCTGCTTCGGgtaatagttt ... ttttcaacagAGCTCCGATTGGCCAGGGTTATGGCTTGACCGAGACTTGTGCTGGTGCGAC
tttgacgagttgatgtgttcatcttaagttgacgaagtgagtaatttttcaacagAGCTCCGATTGGCCAGGGTTATGGCTTGACCGAGACTTGTGCTGGTGCGACGTTTAGTGAATGGGATGACACTTCTGTTGGACGTGTTGGACCTCCTGTA
tttttc CT-rich tract
taatttttcaa TA-rich tract