1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' |
...attttgatagtcggcatggaagttaatacacttggtgaggaccttttcaatttacatacacatttctctgatttttgggttcttgtctcttattatgcagATCGAGCCTCATGACTACATTGCCGAGCTTTATGATGCTGTGATTCGCTTTAACAACATTTTGCTTGGCTTTGACCGCGATGTGTGGTCCTATATCTCAT
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S78_3V6.1 |
intron # | 6 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CATACACAACCCAG ATCGAGCCTCATGACTACATTGCCGAGCTTTATGATGCTGTGATTCGCTTTEST: gi|162231111|gb|FC406222.1|FC406222
genomic: CATACACAACCCAGgtttgattat ... tattatgcagATCGAGCCTCATGACTACATTGCCGAGCTTTATGATGCTGTGATTCGCTTT
EST: AAAGCTTTGTCACATCCTTGGGTTTAACCTTCAATCCATACACAACCCAG ATCGAGCCTCATGACTACATTGCCGAGCTTTATGATGCTGTGATTCGCTTT
genomic: AAAGCTTTGTCACATCCTTGGGTTTAACCTTCAATCCATACACAACCCAGgtttgattat ... tattatgcagATCGAGCCTCATGACTACATTGCCGAGCTTTATGATGCTGTGATTCGCTTT
ttcaatttacatacacatttctctgatttttgggttcttgtctcttattatgcagATCGAGCCTCATGACTACATTGCCGAGCTTTATGATGCTGTGATTCGCTTTAACAACATTTTGCTTGGCTTTGACCGCGATGTGTGGTCCTATATCTCAT
ctctgat putative branch site (score: 4)
ttcttgtctcttatt putative PPT
tcttattat TA-rich tract