1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' |
...tttgtccattcgttgcttatcagatttcactattgtttgtagtggtgattagtacccgttgtatctgaagtctcattgacgaggttattatcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCCCTCGGAGAATTCATCTTGACGCACCCTAATATCAAG
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S1_300V6.2 |
intron # | 6 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCCTCEST: gi|100372971|gb|BY949374.1|BY949374
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCC-TC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGNTACTGAGCACAGGTGCAGGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATNCCCTEST: gi|208376930|gb|DC910792.1|DC910792
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGG-TTAATGGATTCACCCTTGAT-CCCT
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGEST: gi|100385122|gb|BY987585.1|BY987585
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAG
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGEST: gi|162278601|gb|FC454999.1|FC454999
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGG
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCCEST: gi|208365212|gb|DC950739.1|DC950739
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTACTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCCEST: gi|100450318|gb|CJ974203.1|CJ974203
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TGGGTACTGAGCACAGGEST: gi|100423945|gb|BY976600.1|BY976600
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGG
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCAEST: gi|162193915|gb|FC371728.1|FC371728
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCA
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCCEST: gi|208398969|gb|DC912128.1|DC912128
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGANCACAGGTGCAGGGGTTANTGGATTCACCCTTGATCCCTCEST: gi|162171403|gb|FC346678.1|FC346678
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCCEST: gi|208378504|gb|DC927201.1|DC927201
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCCEST: gi|208347328|gb|DC909719.1|DC909719
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTAGGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACEST: gi|208396143|gb|DC924609.1|DC924609
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCAC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCCEST: gi|100404176|gb|BY955293.1|BY955293
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGGTAATGGATTCACCCTTTGATCC-TCEST: gi|208348185|gb|DC920976.1|DC920976
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTT-GATCCCTC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCCEST: gi|100445533|gb|CJ975682.1|CJ975682
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TGGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAEST: gi|100451052|gb|CJ974573.1|CJ974573
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTA
EST: GCACTGCAATGCTNGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAANTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCNCCCTTGATCCCEST: gi|208393616|gb|DC904332.1|DC904332
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCCEST: gi|100380980|gb|BY986828.1|BY986828
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGEST: gi|208391526|gb|DC937674.1|DC937674
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTG
EST: GCACTGCAATGCTTGCTACTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCCEST: gi|100410811|gb|BY956199.1|BY956199
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
EST: CACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGGAAGT-CATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGEST: gi|162152140|gb|FC328730.1|FC328730
genomic: CACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGG-AAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTG
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCCEST: gi|18333622|gb|BJ165637.1|BJ165637
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCCEST: gi|208373427|gb|DC931872.1|DC931872
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCCEST: gi|100391045|gb|BY953055.1|BY953055
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCCEST: gi|208394809|gb|DC920152.1|DC920152
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCCEST: gi|208352123|gb|DC906268.1|DC906268
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
EST: CACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCCEST: gi|100449051|gb|CJ973350.1|CJ973350
genomic: CACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATG-TATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TGGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGEST: gi|100360619|gb|BY984209.1|BY984209
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGG
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGGTCATGCACC TTGGTACTGAGCAEST: gi|208380958|gb|DC903870.1|DC903870
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCA
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCCEST: gi|100352928|gb|BY945520.1|BY945520
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCCEST: gi|208378151|gb|DC902624.1|DC902624
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTAGGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCCEST: gi|208352801|gb|DC917765.1|DC917765
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCCEST: gi|208385201|gb|DC923581.1|DC923581
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACN TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCNCCCTTGATCCCTCCEST: gi|208352520|gb|DC918229.1|DC918229
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCCEST: gi|162171402|gb|FC346677.1|FC346677
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCCEST: gi|208350215|gb|DC901599.1|DC901599
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTAGGTATGGAAGNTCATGCACC TTGNTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCCEST: gi|208398545|gb|DC916516.1|DC916516
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCCEST: gi|100448828|gb|CJ973127.1|CJ973127
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTNCATGCACC TTGGTACTGAGCAEST: gi|100445852|gb|CJ970151.1|CJ970151
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCA
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTAGGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCCEST: gi|100362014|gb|BY947740.1|BY947740
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCCEST: gi|208358947|gb|DC946376.1|DC946376
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCCEST: gi|100353087|gb|BY945599.1|BY945599
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCCEST: gi|18338549|gb|BJ170573.1|BJ170573
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGNAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAGTGGATTCACCCTTGATCCCTCCEST: gi|162278600|gb|FC454998.1|FC454998
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAAAGGATTCACCCTTGATCCCTCCEST: gi|208384630|gb|DC907103.1|DC907103
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCCEST: gi|162193916|gb|FC371729.1|FC371729
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCCEST: gi|208349119|gb|DC925902.1|DC925902
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
EST: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACC TTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
genomic: GCACTGCAATGCTTGCTGCTGGCTATTGTATGTATGGAAGTTCATGCACCgtaaggactc ... tcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCC
tgattagtacccgttgtatctgaagtctcattgacgaggttattatcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCCCTCGGAGAATTCATCTTGACGCACCCTAATATCAAG
cattgac putative branch site (score: 27)
ttatctttt putative PPT
ttattatctttt TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| tttgtccattcgttgcttatcagatttcactattgtttgtagtggtgattagtacccgttgtatctgaagtctcattgacgaggttattatcttttgcagTTGGTACTGAGCACAGGTGCAGGGGTTAATGGATTCACCCTTGATCCCTCCCTCGGAGAATTCATCTTGACGCACCCTAATATCAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGAA