1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
...cctgtgtacatcagccaaatcaaaacgtggtttggtctgttagcaatttcaatgtcttttgtaactgctgacgcgattccttttgctggtctctgtacagGTCGGTTTCAATATGCGTAAAGTGTCGAAGGGCAATGTTACTATCAAACTGTGGGATTTGGGTGGCCAACCCCGCTTTCGTAGTATGTGGGAGCGCTACT
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S6_409V6.2 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ACTGGTGGTTATAGCGAAGATATGATTCCCACC GTCGGTTTCCAATATGCGTAAAGTGTCGAAGGGCAATGTTACTATCAAACTEST: gi|208382259|gb|DC919247.1|DC919247
genomic: ACTGGTGGTTATAGCGAAGATATGATTCCCACCgtaagtgctt ... ctctgtacagGTCGGTTT-CAATATGCGTAAAGTGTCGAAGGGCAATGTTACTATCAAACT
EST: ACTGGTGGTTATAGCGAAGATATGATTCCCACC GTCGGTTTCAATATGCGTAAAGTGTCGAAGGGCAATGTTACTATCAAACTGEST: gi|208348042|gb|DC905365.1|DC905365
genomic: ACTGGTGGTTATAGCGAAGATATGATTCCCACCgtaagtgctt ... ctctgtacagGTCGGTTTCAATATGCGTAAAGTGTCGAAGGGCAATGTTACTATCAAACTG
EST: ACTGGTGGTTATAGCGAAGATATGATTCCCACC GTCGGTTTCAATATGCGTAAAGTGTCGAAGGGCAATGTTACTATCAAACTGEST: gi|100430815|gb|BY978411.1|BY978411
genomic: ACTGGTGGTTATAGCGAAGATATGATTCCCACCgtaagtgctt ... ctctgtacagGTCGGTTTCAATATGCGTAAAGTGTCGAAGGGCAATGTTACTATCAAACTG
EST: ACTGGTGGTTATAGCGAAGATATGATTCCCACC GTCGGTTTCAATATGCGTAAAGTGTCGAAGGGCAATGTTACTATCAAACTGEST: gi|208391260|gb|DC933521.1|DC933521
genomic: ACTGGTGGTTATAGCGAAGATATGATTCCCACCgtaagtgctt ... ctctgtacagGTCGGTTTCAATATGCGTAAAGTGTCGAAGGGCAATGTTACTATCAAACTG
EST: ACTGGTGGTTATAGCGAAGATATGATTCCCACC GTCGGTTTCAATATGCGTAAAGTGTCGAAGGGCAATGTTACTATCAAACTGEST: gi|208373818|gb|DC936589.1|DC936589
genomic: ACTGGTGGTTATAGCGAAGATATGATTCCCACCgtaagtgctt ... ctctgtacagGTCGGTTTCAATATGCGTAAAGTGTCGAAGGGCAATGTTACTATCAAACTG
EST: ACTGGTGGTTATAGCGAAGATATGATTCCCACC GTCGGTTTCAATATGCGTAAAGTGTCGAAGGGCAATGTTACTATCAAACTGEST: gi|208360397|gb|DC930778.1|DC930778
genomic: ACTGGTGGTTATAGCGAAGATATGATTCCCACCgtaagtgctt ... ctctgtacagGTCGGTTTCAATATGCGTAAAGTGTCGAAGGGCAATGTTACTATCAAACTG
EST: ACTGGTGGTTATAGCGAAGATATGATTCCCACC GTCGGTTTCAATATGCGTAAAGTGTCGAAGGGCAATGTTACTATCAAACTGEST: gi|100379138|gb|BY986594.1|BY986594
genomic: ACTGGTGGTTATAGCGAAGATATGATTCCCACCgtaagtgctt ... ctctgtacagGTCGGTTTCAATATGCGTAAAGTGTCGAAGGGCAATGTTACTATCAAACTG
EST: ACTGGTGGTTATAGCGAAGATATGATTCCCACC GTCGGTTTCAATATGCGTAAAGTGTCGAAGGGCAATGTTACTATCAAACTGEST: gi|208374248|gb|DC945294.1|DC945294
genomic: ACTGGTGGTTATAGCGAAGATATGATTCCCACCgtaagtgctt ... ctctgtacagGTCGGTTTCAATATGCGTAAAGTGTCGAAGGGCAATGTTACTATCAAACTG
EST: ACTGGTGGTTATAGCGAAGATATGATTCCCACC GTCGGTTTCAATATGCGTAAAGTGTCGAAGGGCAATGTTACTATCAAACTGEST: gi|100416820|gb|BY993105.1|BY993105
genomic: ACTGGTGGTTATAGCGAAGATATGATTCCCACCgtaagtgctt ... ctctgtacagGTCGGTTTCAATATGCGTAAAGTGTCGAAGGGCAATGTTACTATCAAACTG
EST: ACTGGTGGTTATAGCGAAGATATGATTCCCACC GTCGGTTTCAATATGCGTAAAGTGTCGAAGGGCAATGTTACTATCAAACTGEST: gi|100417855|gb|BY975687.1|BY975687
genomic: ACTGGTGGTTATAGCGAAGATATGATTCCCACCgtaagtgctt ... ctctgtacagGTCGGTTTCAATATGCGTAAAGTGTCGAAGGGCAATGTTACTATCAAACTG
EST: ACTGGTGGTTATAGCGAAGATATGATTCCCACC GTCGGTTTCAATATGCGTAAAGTGTCGAAGGGCAATGTTACTATCAAACTGEST: gi|162203521|gb|FC380437.1|FC380437
genomic: ACTGGTGGTTATAGCGAAGATATGATTCCCACCgtaagtgctt ... ctctgtacagGTCGGTTTCAATATGCGTAAAGTGTCGAAGGGCAATGTTACTATCAAACTG
EST: ACTGGTGGTTATAGCGAAGATATGATTCCCACC GTCGGTTTCAATATGCGTAAAGTGTCGAAGGGCAATGTTACTATCAAACTG
genomic: ACTGGTGGTTATAGCGAAGATATGATTCCCACCgtaagtgctt ... ctctgtacagGTCGGTTTCAATATGCGTAAAGTGTCGAAGGGCAATGTTACTATCAAACTG
atttcaatgtcttttgtaactgctgacgcgattccttttgctggtctctgtacagGTCGGTTTCAATATGCGTAAAGTGTCGAAGGGCAATGTTACTATCAAACTGTGGGATTTGGGTGGCCAACCCCGCTTTCGTAGTATGTGGGAGCGCTACT
tgctgac putative branch site (score: 2)
tctctgt putative PPT
ttttgtaa TA-rich tract