Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...tcctttttctcatggagtagtgcgtctgaagacacccgaatactttctggttaagtaggtgcaagcattgtgtgacgatgttagcgggtttggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTCAAGGACGGCTACATGATTTCATCCGGAAGCCCTGTCAATGATTACATCG

Basic information

species Physcomitrella patens
transcript PP1S454_3V6.1
intron # 4
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: PP1S454_3V6.1 (Physcomitrella patens), 3'ss of exon 4
lower sequence: LOC_Os03g38000.2 (Oryza sativa), 3'ss of exon 2
tcctttttctcatggagtagtgcgtctgaagacacccgaatactttctggtta-agtaggtgcaagcattgt-gtgacgatgttagcgggtttggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTCAAGGACGGCTACATGATTTCATCCGGAAGCCCTGTCAATGATTACATCG
              ||||     ||   |  | |     ||        || | | |  || ||  ||||   ||     || |  |    ||    | ||||||||||| ||||| |||||  | |||   || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||    || |||||||| ||||| |
------------gtgagttccttgtacaataaaaattacatgtgcaaatgtgatattttgtacacacattaaagttgaactgatccctttattcttattcagGTCATTGTAAGTGGAAAGCTCAGGGCCCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTCAAGGATGGTTACATGATCTCATCTGGTCAGCCAGTCAATGAGTACATTG

upper sequence: PP1S454_3V6.1 (Physcomitrella patens), 3'ss of exon 4
lower sequence: LOC_Os07g41750.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 4
tcctttttctcatggagtagtgcgtctgaagacacccgaatactttctggttaagtaggtgcaagcattgtgtgacgatgttagcgggtttggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTCAAGGACGGCTACATGATTTCATCCGGAAGCCCTGTCAATGATTACATCG
             | | |     |    | || | | | ||  ||| || ||   |   |||     || |||   ||| |       ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||  | ||     | || || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||    ||||| ||    || || |
-------------gtactctcatgcaaaacgaaagctgtatggttt-tgcttggattcctgctctatttatgtattgatttgctgttctttggtttacagGTTATTGTGAGTGGGAAGCTTAGGGCTCAGCGTGCTAAATCCATGAAGTTCAAGGACGGATACATGATTTCTTCTGGTTATCCTGTTAACTTGTATATTG

upper sequence: PP1S454_3V6.1 (Physcomitrella patens), 3'ss of exon 4
lower sequence: GRMZM2G099352_T02 (Zea mays), 3'ss of exon 1
tcctttttctcatggagtagtgcgtctgaagacacccgaatactttctggttaagtaggtgcaagcattgtgtgacgatgttagcgggtttggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTCAAGGACGGCTACATGATTTCATCCGGAAGCCCTGTCAATGATTACATCG
                  ||||   ||    ||  ||  | |   | |   |  ||  ||| | ||||   |  |   | |       ||    |  ||||| || || ||||| |||||  | |||   || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    || || || || ||||| |
---------------gtgagtgttcctttgtacttcctgagaacatgttcatttgttagtgaatgcatctcgacagcctttgtctcttttaaaataacagGTGATCGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCCCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTCAAGGATGGCTACATGATCTCATCTGGTCAGCCAGTGAACGAGTACATTG

upper sequence: PP1S454_3V6.1 (Physcomitrella patens), 3'ss of exon 4
lower sequence: GRMZM2G074300_T03 (Zea mays), 3'ss of exon 2
tcctttttctcatggagtagtgcgtctgaagacacccgaatactttctggttaagtaggtgcaagcattgtgtgacgatgttagcgggtttggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTCAAGGACGGCTACATGATTTCATCCGGAAGCCCTGTCAATGATTACATCG
         |  ||     ||||      ||    | |   | |||||| | |  | |||| | |||| ||  |||    |||   | | |    | ||||||||||| ||||| |||||  | ||    || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    || || ||||| |||||||
-------gttagtgctcctgtgcactatgagg-gtctgttcattttctgatga--ttggtgaatgcat-gt-cgacagccttatttgttctaa--tacagGTCATTGTGAGTGGAAAGCTCAGGGCTCAAAGAGCCAAGTCCATGAAGTTCAAGGATGGCTACATGATCTCATCTGGTCAGCCAGTGAATGAGTACATCG

upper sequence: PP1S454_3V6.1 (Physcomitrella patens), 3'ss of exon 4
lower sequence: GRMZM2G093902_T02 (Zea mays), 3'ss of exon 4
------tcctttttctcatggagtagtgcgtctgaagacacccgaatactttctggttaagtaggtgcaagcattgtgtgacgatgttagcgggtttggcttgc-agGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTCAAGGACGGCTACATGATTTCATCCGGAAGCCCTGTCAATGATTACATCG
       ||   ||| ||     | ||    |     | |    | ||      | |   | |  || || |  | | |     | | |||   ||||  ||   |||| ||||| ||||| |||||  | ||     | || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||    ||||||||    ||||| |
gtgtgagcccccttccca----attgtaaaccaatgcaaatttaattagagctcgttcgtg-atatggaatctctatatt----tataagcccttttgttttcttagGTTATTGTAAGTGGTAAGCTCAGGGCTCAGCGTGCTAAGTCTATGAAGTTCAAGGATGGGTACATGATTTCTTCTGGTCATCCTGTCAACCTATACATTG

upper sequence: PP1S454_3V6.1 (Physcomitrella patens), 3'ss of exon 4
lower sequence: GLYMA09G28440.1 (Glycine max), 3'ss of exon 4
tcctttttctcatggagtagtgcgtctgaagacacccgaatactttctggttaagtaggtgcaagcattgtgtgacgatgttagcgggtttggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTCAAGGACGGCTACATGATTTCATCCGGAAGCCCTGTCAATGATTACATCG
                   ||  || | | |    || |||| | | | | |   || ||    |  | || ||    ||||    |  |||    |||||||||||| ||||| || ||| | ||    || |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || |||   |||||||| |||||||| |
-------------------gtttgttttatggactcctaatattgtattgctt--tatgtaatggtttggt-tgtaattgttgtttgacttga---gcagGTCATTGTTAGTGGAAAACTGAGAGCTCAGAGAGCCAAGTCCATGAAATTCAAGGATGGATACATGATTTCTTCTGGACAACCTGTCAAGGATTACATTG

upper sequence: PP1S454_3V6.1 (Physcomitrella patens), 3'ss of exon 4
lower sequence: EFJ31038 (Selaginella moellendorffii), 3'ss of exon 4
tcctttttctcatggagtagtgcgtctgaagacacccgaatactttctggttaagtaggtgcaagcattgtgtgacgatgttagcgggtttggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTCAAGGACGGCTACATGATTTCATCCGGAAGCCCTGTCAATGATTACATCG
                                     | |     ||| |  |  | | |       ||||   ||  | ||   || |    ||| ||||| ||||| || |||||||| || |||    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||| || || || | |||||
---------------------------------gtatggacgaactctcggcattttgctcttcaggttgt--aactttattcctggctc---ctttcagGTGATTGTGAGCGGCAAGCTCCGAGCCCAACGCGCCAAGTCGATGAAGTTCAAGGACGGATACATGATCTCGTCTGGCAGCCCCGTGAACGAGTTCATCG

upper sequence: PP1S454_3V6.1 (Physcomitrella patens), 3'ss of exon 4
lower sequence: EFJ34304 (Selaginella moellendorffii), 3'ss of exon 4
tcctttttctcatggagtagtgcgtctgaagacacccgaatactttctggttaagtaggtgcaagcattgtgtgacgatgttagcgggtttggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTCAAGGACGGCTACATGATTTCATCCGGAAGCCCTGTCAATGATTACATCG
                                     | |     ||| |  |  | | |       ||||   ||    ||   || |    ||| ||||| ||||| || |||||||| || |||    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||| || || || | ||| |
---------------------------------gtatggacgaactctcggcattttgctcttcaggttgt--aacttcattcctggctc---ctttcagGTGATTGTGAGCGGCAAGCTCCGAGCCCAACGCGCCAAGTCGATGAAGTTCAAGGACGGATACATGATCTCGTCTGGCAGCCCCGTGAACGAGTTCATTG

upper sequence: PP1S454_3V6.1 (Physcomitrella patens), 3'ss of exon 4
lower sequence: EFJ34676 (Selaginella moellendorffii), 3'ss of exon 4
tcctttttctcatggagtagtgcgtctgaagacacccgaatactttctggttaagtaggtgcaagcattgtgtgacgatgttagcgggtttggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTCAAGGACGGCTACATGATTTCATCCGGAAGCCCTGTCAATGATTACATCG
                                     | |     ||| |  |  | | |       ||||   ||  | ||   || |    ||| ||||| ||||| || |||||||| || |||    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||| || || || | ||| |
---------------------------------gtatggacgaactctcggcattttgctcttcaggttgt--aactttattcctggctc---ctttcagGTGATTGTGAGCGGCAAGCTCCGAGCCCAACGCGCCAAGTCGATGAAGTTCAAGGACGGATACATGATCTCGTCTGGCAGCCCCGTGAACGAGTTCATTG

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|162222732|gb|FC398986.1|FC398986
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|18332160|gb|BJ164173.1|BJ164173
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGGGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTG
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTG
EST: gi|18366824|gb|BJ198904.1|BJ198904
EST:     CTACGGAGTGTTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTTATGAAGTT
genomic: CTACGGAGTGTT-GAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCT-ATGAAGTT
EST: gi|18349939|gb|BJ181990.1|BJ181990
EST:     CTACGGAAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: CTACGGA-GTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|18361517|gb|BJ193583.1|BJ193583
EST:     CTACGGAGTGTTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: CTACGGAGTGTT-GAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|37827833|gb|BJ585845.1|BJ585845
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|18333003|gb|BJ165017.1|BJ165017
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|208365648|gb|DC944118.1|DC944118
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|18355674|gb|BJ187733.1|BJ187733
EST:     GCTACGNAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|162239611|gb|FC416867.1|FC416867
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|37846539|gb|BJ604547.1|BJ604547
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|18338770|gb|BJ170795.1|BJ170795
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|162239612|gb|FC416868.1|FC416868
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|19790024|gb|BQ041654.1|BQ041654
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|37839859|gb|BJ597867.1|BJ597867
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|67704629|gb|BJ964862.1|BJ964862
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|37846140|gb|BJ604148.1|BJ604148
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|18328399|gb|BJ160404.1|BJ160404
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|37835173|gb|BJ593185.1|BJ593185
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGATAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGTTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|162234787|gb|FC409273.1|FC409273
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|37830125|gb|BJ588137.1|BJ588137
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|37832573|gb|BJ590585.1|BJ590585
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|18366022|gb|BJ198100.1|BJ198100
EST:     CTACGGAGTGTTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGC
genomic: CTACGGAGTGTT-GAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGC
EST: gi|18331036|gb|BJ163042.1|BJ163042
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCT
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCT
EST: gi|18362603|gb|BJ194674.1|BJ194674
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|18366162|gb|BJ198240.1|BJ198240
EST:     CTACGGAGTGTTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGG
genomic: CTACGGAGTGTT-GAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGG
EST: gi|18363366|gb|BJ195438.1|BJ195438
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|37831537|gb|BJ589549.1|BJ589549
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|18340854|gb|BJ172885.1|BJ172885
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|162245549|gb|FC424103.1|FC424103
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|162221281|gb|FC398091.1|FC398091
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|162267185|gb|FC442597.1|FC442597
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|162230385|gb|FC406949.1|FC406949
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|67698406|gb|BJ958639.1|BJ958639
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|162222733|gb|FC398987.1|FC398987
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|162274010|gb|FC450357.1|FC450357
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|162246025|gb|FC421888.1|FC421888
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|162274011|gb|FC450358.1|FC450358
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|208393090|gb|DC929585.1|DC929585
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|67574976|gb|BJ947800.1|BJ947800
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|18325037|gb|BJ157033.1|BJ157033
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|208355655|gb|DC929933.1|DC929933
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAANGGTTGTGAG                         GTCATTGTCANTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|100399202|gb|BY954251.1|BY954251
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|100400230|gb|BY954373.1|BY954373
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|18350200|gb|BJ182251.1|BJ182251
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|18339829|gb|BJ171856.1|BJ171856
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|37828911|gb|BJ586923.1|BJ586923
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|162242773|gb|FC416412.1|FC416412
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|162209056|gb|FC385608.1|FC385608
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|162247731|gb|FC423389.1|FC423389
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|100370712|gb|BY948478.1|BY948478
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|162245548|gb|FC424102.1|FC424102
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|18350797|gb|BJ182848.1|BJ182848
EST:     TACGGNAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: TACGG-AGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGG-TTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|18334880|gb|BJ166897.1|BJ166897
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|37842073|gb|BJ600081.1|BJ600081
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|162247730|gb|FC423388.1|FC423388
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|18343042|gb|BJ175079.1|BJ175079
EST:     TACGGNAGTGTTGAGGTTCATTAATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATG
genomic: TACGG-AGTGTTGAGGTTCATTA-TGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATG
EST: gi|162209055|gb|FC385607.1|FC385607
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|162221282|gb|FC398092.1|FC398092
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|18329924|gb|BJ161930.1|BJ161930
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCT
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCT
EST: gi|18336627|gb|BJ168650.1|BJ168650
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|37839226|gb|BJ597234.1|BJ597234
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|37829172|gb|BJ587184.1|BJ587184
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|18355633|gb|BJ187692.1|BJ187692
EST:     CTACGGNAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: CTACGG-AGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|37845967|gb|BJ603975.1|BJ603975
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
EST: gi|162242772|gb|FC416411.1|FC416411
EST:     GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAG                         GTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC
genomic: GCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTC

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 1 RNA-Seqlibrary.


Block sizes: 34 (upstream exon), 34 (downstream exon)
Score: 46

GGCGTGCTACGGAGTGTTGAGGTTCATTATGGAGAGCGGTGCTAAGGGTTGTGAGgtaagtttca ... tggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTCAAGGACGGCTACATGATTTCATCCGGAAGCCCTGTCAATGATTACATCG




<











<


<











 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

tctggttaagtaggtgcaagcattgtgtgacgatgttagcgggtttggcttgcagGTCATTGTCAGTGGCAAGCTGCGTGCCGCTAGGGCCAAGTCTATGAAGTTCAAGGACGGCTACATGATTTCATCCGGAAGCCCTGTCAATGATTACATCG
     ttaagta  TA-rich tract