ERISdb: a Database of Plant Splice Sites

General
Orthologs
EST
PPT, BS, UA-tract

Sequence

atgc intronic sequence ATGC exonic sequence

gtaagcagagtggtggtttcagtggtgttgttttagatggtggagtggtgagttggatggcaggcggtgcggtaggtgtgataggtgctggcgcatctccgacaacgccgttaactgtggagttctgatgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGTGCCCGGCGGTGATCTTGCCAAGGTCCAACGGGCGGTGTGCATGATCAGC

Basic information

species	Physcomitrella patens
transcript	PP1S215_51V6.1
intron #	4
splice site	3'
intron type	U2

Orthologous splice sites

atgc intronic sequence ATGC exonic sequence

upper sequence: PP1S215_52V6.1 (Physcomitrella patens), 3'ss of exon 2
lower sequence: LOC_Os03g11970.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 4

gtaagcagagtggtggtttcagtggtgttgttttagatggtggagtggtgagttggatggcaggcggtgcggtaggtgtgataggtgctggcgcatctccgacaacgccgttaactgtggagttctgatgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGTGCCCGGCGGTGATCTTGCCAAGGTCCAACGGGCGGTGTGCATGATCAGC
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upper sequence: PP1S215_52V6.1 (Physcomitrella patens), 3'ss of exon 2
lower sequence: GRMZM2G051782_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 4

gtaagcagagtggtggtttcagtggtgttgttttagatggtggagtggtgagttggatggcaggcggtgcggtaggtgtgataggtgctggcgcatctccgacaacgccgttaactgtggagttctgatgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGTGCCCGGCGGTGATCTTGCCAAGGTCCAACGGGCGGTGTGCATGATCAGC
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--gtatatgctcacaactcttaccaagttatatcagattatagattgtaatcttccactgaaaa------gatagctgcgcgagacatgaatgtctttct-------ctgctgtct------------catgcacagGTGCCCTACTGGTTTCAAGTGTGGGATAAACTACCAACCACCAACTGTAGTCCCTGGAGGGGACCTGGCCAAGGTGCAACGAGCAGTCTGCATGATCAGC

upper sequence: PP1S215_52V6.1 (Physcomitrella patens), 3'ss of exon 2
lower sequence: AT1G64740.1 (Arabidopsis thaliana), 3'ss of exon 4

gtaagcagagtggtggtttcagtggtgttgttttagatggtggagtggtgagttggatggcaggcggtgcggtaggtgtgataggtgctggcgcatctccgacaacgc-cgttaactgtggagttctgatgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGTGCCCGGCGGTGATCTTGCCAAGGTCCAACGGGCGGTGTGCATGATCAGC
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----------------------------------------------------gtaaagagctcacactactagtgtttctttctctcttaagtctccttctactacacatttcaaatctttggtcatgttaaaattagGTGCCCAACTGGATTCAAGTGCGGGATAAACTACCAGCCGCCTTCCGTTGTTCCAGGTGGTGACCTGGCTAAGGTTCAACGAGCGGTTTGCATGATCAGC

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments

ATGC    EST sequence
ATGC    genomic sequence (exon)
ATGC    genomic sequence (truncated intron)

EST: gi|208346094|gb|DC917047.1|DC917047

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|162150460|gb|FC326108.1|FC326108

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|162155994|gb|FC332751.1|FC332751

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|208356253|gb|DC946259.1|DC946259

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|162151961|gb|FC328391.1|FC328391

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|162189960|gb|FC366131.1|FC366131

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|162235826|gb|FC412377.1|FC412377

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|162206612|gb|FC382370.1|FC382370

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|37826627|gb|BJ584639.1|BJ584639

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTTCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|162157131|gb|FC333701.1|FC333701

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|162174048|gb|FC350563.1|FC350563

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|37834433|gb|BJ592445.1|BJ592445

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|37839265|gb|BJ597273.1|BJ597273

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTTCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|162236615|gb|FC413710.1|FC413710

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|162184170|gb|FC360450.1|FC360450

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|67720768|gb|BJ971027.1|BJ971027

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|18334227|gb|BJ166243.1|BJ166243

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|37845784|gb|BJ603792.1|BJ603792

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|162154808|gb|FC331122.1|FC331122

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTTCA-GTGCGGGATTAACTAC
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTT-CAAGTGCGGGATTAACTAC

EST: gi|162229907|gb|FC404360.1|FC404360

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|162149804|gb|FC325919.1|FC325919

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|162152655|gb|FC328322.1|FC328322

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|208361956|gb|DC950447.1|DC950447

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|37838788|gb|BJ596796.1|BJ596796

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|162192536|gb|FC369140.1|FC369140

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|67720168|gb|BJ970427.1|BJ970427

EST:     GCCGCCGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|162161586|gb|FC338793.1|FC338793

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|37843825|gb|BJ601833.1|BJ601833

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|162164962|gb|FC342153.1|FC342153

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|67727240|gb|BJ977499.1|BJ977499

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|22492701|gb|BU052624.1|BU052624

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|67728303|gb|BJ978562.1|BJ978562

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|162236616|gb|FC413711.1|FC413711

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|67720740|gb|BJ970999.1|BJ970999

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|162213439|gb|FC389116.1|FC389116

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|162194963|gb|FC369041.1|FC369041

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|208376491|gb|DC922522.1|DC922522

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|67726871|gb|BJ977130.1|BJ977130

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGAATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

EST: gi|37852711|gb|BJ610719.1|BJ610719

EST:     GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTG                         GTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT
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genomic: GCCGCTGTTGCCACTATCAAGACCAAGCGCACAGTGCAATTTGTGGACTGgtaagcagag ... atgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGT

atgc intronic sequence ATGC exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

aggtgctggcgcatctccgacaacgccgttaactgtggagttctgatgtgtgtagGTGTCCAACTGGTTTCAAGTGCGGGATTAACTACCAGCCACCAACCGTGGTGCCCGGCGGTGATCTTGCCAAGGTCCAACGGGCGGTGTGCATGATCAGC

                                        ttctgat  putative branch site (score: 3)

Data associated with selected splice site

Sequence

Basic information

Orthologous splice sites

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments