1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
...agcgttgattagggcttgtctccttagtgcattcatcaacaatgccatggagttttgagctgttccatcaagcatgacttggggcgtttatgttgtgcagGTAGAGATGAATGGTGTGAATTGTTTCAACATGATAAAAAGTCTTCCGGCTGAGGTTGATTGGGAACTAGAATG
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S47_78V6.2 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TGCTGCAAGGCTTGGTGTGGAAGTCCATTCAGCCCAGGCCTGTTGTCTCG GTAGAGATGAATGGTGTGAATTGTTTTCA-CATGATAAAAAGTCTTCCGGCEST: gi|208387521|gb|DC933384.1|DC933384
genomic: TGCTGCAAGGCTTGGTGTGGAAGTCCATTCAGCCCAGGCCTGTTGTCTCGgtgcgtgagc ... tgttgtgcagGTAGAGATGAATGGTGTGAATTGTTT-CAACATGATAAAAAGTCTTCCGGC
EST: TGCTGCAAGGCTTGGTGTGGAAGTCCATTCAGCCCAGGCCTGTTGTCTCG GTAGAGATGAATGGTGTGAATTGTTTCAACATGATAAAAAGTCTTCCGGCTEST: gi|208354003|gb|DC930129.1|DC930129
genomic: TGCTGCAAGGCTTGGTGTGGAAGTCCATTCAGCCCAGGCCTGTTGTCTCGgtgcgtgagc ... tgttgtgcagGTAGAGATGAATGGTGTGAATTGTTTCAACATGATAAAAAGTCTTCCGGCT
EST: TGCTGCAAGGCTTGGTGTGGAAGTCCATTCANCCCAGGCCTGTTGTCTCG GTAGAGATGAATGGTGTGAATTGTTTCAACATGATAAAAAGTCTTCCGGCTEST: gi|100377035|gb|BY949586.1|BY949586
genomic: TGCTGCAAGGCTTGGTGTGGAAGTCCATTCAGCCCAGGCCTGTTGTCTCGgtgcgtgagc ... tgttgtgcagGTAGAGATGAATGGTGTGAATTGTTTCAACATGATAAAAAGTCTTCCGGCT
EST: TGCTGCAAGGCTTGGTGTGGAAGTCCATTCAGCCCAGGCCTGTTGTCTCG GTAGAGATGAATGGTGTGAATTGTNNTCA-CATGANTAAAA-GTCT-CCNGEST: gi|100414748|gb|BY956844.1|BY956844
genomic: TGCTGCAAGGCTTGGTGTGGAAGTCCATTCAGCCCAGGCCTGTTGTCTCGgtgcgtgagc ... tgttgtgcagGTAGAGATGAATGGTGTGAATTGTT-TCAACATGA-TAAAAAGTCTTCC-G
EST: TGCTGCAAGGCTTGGTGTGGAAGTCCATTCAGCCCAGGCCTGTTGTCTCG GTAGAGATGAATGGTGTGAAATTGTTTCAACATGATAAAA-GTCTTCCGGC
genomic: TGCTGCAAGGCTTGGTGTGGAAGTCCATTCAGCCCAGGCCTGTTGTCTCGgtgcgtgagc ... tgttgtgcagGTAGAGATGAATGGTGTGAA-TTGTTTCAACATGATAAAAAGTCTTCCGGC
catggagttttgagctgttccatcaagcatgacttggggcgtttatgttgtgcagGTAGAGATGAATGGTGTGAATTGTTTCAACATGATAAAAAGTCTTCCGGCTGAGGTTGATTGGGAACTAGAATG
tttatgtt TA-rich tract