1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
gtaagtcctattcaatcttctctaaaatctcagtatgactgtctcgtgactaacttggatcatttcaaaaggcgaagcttatttgaacggctcttgattgtaataatctagctttgttgcgatgtgattgtgagcagGTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTGTGTCCATTCTTACCAAAGACCCTGCCTTCCGGCATGTTGTGCAATCAAA
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S47_72V6.1 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCG GTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTGEST: gi|67579076|gb|BJ951227.1|BJ951227
genomic: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCGgtaagtccta ... ttgtgagcagGTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTG
EST: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCG GTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTGEST: gi|162237338|gb|FC412446.1|FC412446
genomic: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCGgtaagtccta ... ttgtgagcagGTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTG
EST: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCG GTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTGEST: gi|67726911|gb|BJ977170.1|BJ977170
genomic: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCGgtaagtccta ... ttgtgagcagGTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTG
EST: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCG GTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTGEST: gi|18336208|gb|BJ168230.1|BJ168230
genomic: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCGgtaagtccta ... ttgtgagcagGTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTG
EST: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCG GTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTGEST: gi|37834963|gb|BJ592975.1|BJ592975
genomic: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCGgtaagtccta ... ttgtgagcagGTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTG
EST: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCG GTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGAAGGTGTGCTTGEST: gi|162237337|gb|FC412445.1|FC412445
genomic: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCGgtaagtccta ... ttgtgagcagGTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTG
EST: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCG GTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTGEST: gi|18362523|gb|BJ194594.1|BJ194594
genomic: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCGgtaagtccta ... ttgtgagcagGTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTG
EST: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCG GTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTGEST: gi|162224246|gb|FC399505.1|FC399505
genomic: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCGgtaagtccta ... ttgtgagcagGTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTG
EST: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCG GTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTGEST: gi|37839438|gb|BJ597446.1|BJ597446
genomic: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCGgtaagtccta ... ttgtgagcagGTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTG
EST: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCG GTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTGEST: gi|37837652|gb|BJ595660.1|BJ595660
genomic: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCGgtaagtccta ... ttgtgagcagGTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTG
EST: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCG GTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTGEST: gi|37839797|gb|BJ597805.1|BJ597805
genomic: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCGgtaagtccta ... ttgtgagcagGTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTG
EST: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCG GTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTGEST: gi|37839869|gb|BJ597877.1|BJ597877
genomic: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCGgtaagtccta ... ttgtgagcagGTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTG
EST: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCG GTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTGEST: gi|162209638|gb|FC385942.1|FC385942
genomic: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCGgtaagtccta ... ttgtgagcagGTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTG
EST: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCG GTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTGEST: gi|37838329|gb|BJ596337.1|BJ596337
genomic: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCGgtaagtccta ... ttgtgagcagGTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTG
EST: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCG GTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTGEST: gi|162261652|gb|FC438085.1|FC438085
genomic: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCGgtaagtccta ... ttgtgagcagGTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTG
EST: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCG GTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTGEST: gi|67697068|gb|BJ957301.1|BJ957301
genomic: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCGgtaagtccta ... ttgtgagcagGTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTG
EST: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCG GTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTGEST: gi|37846181|gb|BJ604189.1|BJ604189
genomic: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCGgtaagtccta ... ttgtgagcagGTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTG
EST: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCG GTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTGEST: gi|37852801|gb|BJ610809.1|BJ610809
genomic: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCGgtaagtccta ... ttgtgagcagGTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTG
EST: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCG GTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTGEST: gi|37835120|gb|BJ593132.1|BJ593132
genomic: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCGgtaagtccta ... ttgtgagcagGTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTG
EST: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCG GTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTGEST: gi|37848625|gb|BJ606633.1|BJ606633
genomic: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCGgtaagtccta ... ttgtgagcagGTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTG
EST: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCG GTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTGEST: gi|37828733|gb|BJ586745.1|BJ586745
genomic: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCGgtaagtccta ... ttgtgagcagGTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTG
EST: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCG GTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTGEST: gi|37822006|gb|BJ580072.1|BJ580072
genomic: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCGgtaagtccta ... ttgtgagcagGTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTG
EST: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCG GTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGAAGGTGTGCTTGEST: gi|162224247|gb|FC399506.1|FC399506
genomic: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCGgtaagtccta ... ttgtgagcagGTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTG
EST: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCG GTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTG
genomic: GGATTATACCCAGAAGCCCGAACGCTATGACGTTGTCTATGACACTGTCGgtaagtccta ... ttgtgagcagGTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTG
ttgaacggctcttgattgtaataatctagctttgttgcgatgtgattgtgagcagGTGAAGGCCCAACTAAAGGAGTCAAAGTGTTGAAGGATGGAGGTGTGCTTGTGTCCATTCTTACCAAAGACCCTGCCTTCCGGCATGTTGTGCAATCAAA
tcttgat putative branch site (score: 13)
ttgattgtaataat TA-rich tract