1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
gtaatggaaacccacgttacgctactcgtggctggctatctggtttgtactttgatgtgtacaagattaagtcctcaaccctgcgcaagtgtgtcgaaccttctaatttcggttgccacattttggaatgcagGTACTTGGAAAAATGCTGGTTGGGGAAGTATTTGGTATGCATCTAATGTGTTGCCGCCTTAAGGGCCAGGACGCAGTGACTAAATTCATGATAGTTCTTA
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S47_31V6.1 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CCGAGTGGAGTCCTTCAATGGAGAAGCTAACAGGATGGAAGAGAGATGAG GTACTTGGAAAAATGCTGGTTGGGGAAGTATTTGGTATGCATCTAATGTGTEST: gi|162200905|gb|FC377308.1|FC377308
genomic: CCGAGTGGAGTCCTTCAATGGAGAAGCTAACAGGATGGAAGAGAGATGAGgtaatggaaa ... tggaatgcagGTACTTGGAAAAATGCTGGTTGGGGAAGTATTTGGTATGCATCTAATGTGT
EST: CCGAGTGGAGTCCTTCAATGGAGAAGCTAACAGGATGGAAGAGAGATGAG GTACTTGGAAAAATGCTGGTTGGGGAAGTATTTGGTATGCATCTAATGTGT
genomic: CCGAGTGGAGTCCTTCAATGGAGAAGCTAACAGGATGGAAGAGAGATGAGgtaatggaaa ... tggaatgcagGTACTTGGAAAAATGCTGGTTGGGGAAGTATTTGGTATGCATCTAATGTGT
ccctgcgcaagtgtgtcgaaccttctaatttcggttgccacattttggaatgcagGTACTTGGAAAAATGCTGGTTGGGGAAGTATTTGGTATGCATCTAATGTGTTGCCGCCTTAAGGGCCAGGACGCAGTGACTAAATTCATGATAGTTCTTA
ttctaat putative branch site (score: 3)
ttctaattt TA-rich tract