1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
gtgaagaatcccccgctcttgactcaagtcacgaagtctcaagctttaggtgcatgtacgttcgcaatgactgaaatctaacttggaaaactggactgtgatgcagCCTTTTAAACAAGTTCCAGTGTTCGAGTGTGGTGACTTTCATCTGTATG
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S46_325V6.2 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TATACTTAAAAGCTGGAGAGCACGACGCTCCATCATGGACCTCCATGACG CCTTTTAAACAAGTTCCAGTGTTCGAGTGTGGTGACTTTCATCTGTATGEST: gi|37833115|gb|BJ591127.1|BJ591127
genomic: TATACTTAAAAGCTGGAGAGCACGACGCTCCATCATGGACCTCCATGACGgtgaagaatc ... tgtgatgcagCCTTTTAAACAAGTTCCAGTGTTCGAGTGTGGTGACTTTCATCTGTATG
EST: CTTAAAAGCTGGAGAGCACGACGCTCCATCATGGACCTCCATGACG CCTTTTAAACAAGTTCCAGTGTTCGAGTGTGGTGACTTTCATCT-TATGEST: gi|208344704|gb|DC905153.1|DC905153
genomic: CTTAAAAGCTGGAGAGCACGACGCTCCATCATGGACCTCCATGACGgtgaagaatc ... tgtgatgcagCCTTTTAAACAAGTTCCAGTGTTCGAGTGTGGTGACTTTCATCTGTATG
EST: TATACTTAAAAGCTGGAGAGCACGACGCTCCATCATGGACCTCCATGACG CCTTTTAAACAAGTTCCAGTGTTCGAGTGTGGTGACTTTCATCTGTATGEST: gi|162269338|gb|FC444816.1|FC444816
genomic: TATACTTAAAAGCTGGAGAGCACGACGCTCCATCATGGACCTCCATGACGgtgaagaatc ... tgtgatgcagCCTTTTAAACAAGTTCCAGTGTTCGAGTGTGGTGACTTTCATCTGTATG
EST: TATACTTAAAAGCTGGAGAGCACGACGCTCCATCATGGACCTCCATGACG CCTTTTAAACAAGTTCCAGTGTTCGAGTGTGGTGACTTTCATCTGTATGEST: gi|208387810|gb|DC941379.1|DC941379
genomic: TATACTTAAAAGCTGGAGAGCACGACGCTCCATCATGGACCTCCATGACGgtgaagaatc ... tgtgatgcagCCTTTTAAACAAGTTCCAGTGTTCGAGTGTGGTGACTTTCATCTGTATG
EST: TATACTTAAAAGCTGGAGAGCACGACGCTCCATCATGGACCTCCATGACG CCTTTTAAACAAGTTCCAGTGTTCGAGTGTGGTGACTTTCATCTGTATGEST: gi|208379946|gb|DC927672.1|DC927672
genomic: TATACTTAAAAGCTGGAGAGCACGACGCTCCATCATGGACCTCCATGACGgtgaagaatc ... tgtgatgcagCCTTTTAAACAAGTTCCAGTGTTCGAGTGTGGTGACTTTCATCTGTATG
EST: TATACTTAAAAGCTGGAGAGCACGACGCTCCATCATGGACCTCCATGACG CCTTTTAAACAAGTTCCAGTGTTCGAGTGTGGTGACTTTCATCTGTATGEST: gi|18357078|gb|BJ189137.1|BJ189137
genomic: TATACTTAAAAGCTGGAGAGCACGACGCTCCATCATGGACCTCCATGACGgtgaagaatc ... tgtgatgcagCCTTTTAAACAAGTTCCAGTGTTCGAGTGTGGTGACTTTCATCTGTATG
EST: TATACTTAAAAGCTGGAGAGCACGACGCTCCATCATGGACCTCCATGACG CCTTTTAAACAAGTTCCAGTGTTCGAGTGTGGTGACTTTCATCTGTATGEST: gi|208363225|gb|DC954383.1|DC954383
genomic: TATACTTAAAAGCTGGAGAGCACGACGCTCCATCATGGACCTCCATGACGgtgaagaatc ... tgtgatgcagCCTTTTAAACAAGTTCCAGTGTTCGAGTGTGGTGACTTTCATCTGTATG
EST: ATCATGGACCTCCATGACG CCTTTTAAACAAGTTCCAGTGTTCGAGTGTGGTGACTTTCATCTGTATGEST: gi|162269339|gb|FC444817.1|FC444817
genomic: ATCATGGACCTCCATGACGgtgaagaatc ... tgtgatgcagCCTTTTAAACAAGTTCCAGTGTTCGAGTGTGGTGACTTTCATCTGTATG
EST: TATACTTAAAAGCTGGAGAGCACGACGCTCCATCATGGACCTCCATGACG CCTTTTAAACAAGTTCCAGTGTTCGAGTGTGGTGACTTTCATCTGTATGEST: gi|208393393|gb|DC942491.1|DC942491
genomic: TATACTTAAAAGCTGGAGAGCACGACGCTCCATCATGGACCTCCATGACGgtgaagaatc ... tgtgatgcagCCTTTTAAACAAGTTCCAGTGTTCGAGTGTGGTGACTTTCATCTGTATG
EST: TATACTTAAAAGCTGGAGAGCACGACGCTCCATCATGGACCTCCATGACG CCTTTTAAACAAGTTCCAGTGTTCGAGTGTGGTGACTTTCATCTGTATG
genomic: TATACTTAAAAGCTGGAGAGCACGACGCTCCATCATGGACCTCCATGACGgtgaagaatc ... tgtgatgcagCCTTTTAAACAAGTTCCAGTGTTCGAGTGTGGTGACTTTCATCTGTATG
gcatgtacgttcgcaatgactgaaatctaacttggaaaactggactgtgatgcagCCTTTTAAACAAGTTCCAGTGTTCGAGTGTGGTGACTTTCATCTGTATG
atctaac putative branch site (score: 2)
aaatctaa TA-rich tract