1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
...ttgtattgtgtctgccgctctctaaagttgacgcagatgtctatctggcaccatgaagcttgacttaatgcatgcttaatttttcgattcgacgttgcagTGTGTGACACTCATAAAATGGCTCGAGGAACGGTTTGAGACGGTCTACAGTCAACATCCAGGTTATCAGGAGGGTGCTTCTCCATTACTGTTACAGCAAC
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S41_1V6.1 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AAGAGCTCGATATTCAACCCGTCCCTAGTCAACGG TGTGTGACACTCATAAAATGGCTCGAGGAACGGTTTGAGACGGTCTACAGTEST: gi|162233825|gb|FC409675.1|FC409675
genomic: AAGAGCTCGATATTCAACCCGTCCCTAGTCAACGGgtgattactt ... gacgttgcagTGTGTGACACTCATAAAATGGCTCGAGGAACGGTTTGAGACGGTCTACAGT
EST: CACTAAGGCTTGCAAAGAGCTCGATATTCAACCCGTCCCTAGTCAACGG TGTGTGACACTCATAAAATGGCTCGAGGAACGGTTTGAGACGGTCTACAGTEST: gi|162233826|gb|FC409676.1|FC409676
genomic: CACTAAGGCTTGCAAAGAGCTCGATATTCAACCCGTCCCTAGTCAACGGgtgattactt ... gacgttgcagTGTGTGACACTCATAAAATGGCTCGAGGAACGGTTTGAGACGGTCTACAGT
EST: TCACTAAGGCTTGCAAAGAGCTCGATATTCAACCCGTCCCTAGTCAACGG TGTGTGACACTCATAAAATGGCTCGAGGAACGGTTTGAGACGGTCTACAGT
genomic: TCACTAAGGCTTGCAAAGAGCTCGATATTCAACCCGTCCCTAGTCAACGGgtgattactt ... gacgttgcagTGTGTGACACTCATAAAATGGCTCGAGGAACGGTTTGAGACGGTCTACAGT
tggcaccatgaagcttgacttaatgcatgcttaatttttcgattcgacgttgcagTGTGTGACACTCATAAAATGGCTCGAGGAACGGTTTGAGACGGTCTACAGTCAACATCCAGGTTATCAGGAGGGTGCTTCTCCATTACTGTTACAGCAAC
gcttaat putative branch site (score: 5)
ttaatttttcgatt TA-rich tract