1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' | 17 5' 3' |
gtaagtgcctggacttctgacagaataaagtctcactctctcacattttcagaatcaagttaagtcaaacatgtagtatagtgaaggatcgttattcgtacttaaaatgatgcttagaattgatgacttctgttggtggatccagaccgaggatggcatctgatgtaaccttgagaaatgattggtgccagGTTTATTCACCGCACTTGGATGCTCCACTTCCTCGGTGGGTGCACTTTGCACATGGCATCCTTCTCTTTCTTTACCAG
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S269_30V6.2 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTACTTTGATGGGCTTTGGGATGATCCTTACTTCAGCGATGTTGAGCTAT GTTTATTCACCGCACTTGGATGCTCCACTTCCTCGGTGGGTGCACTTTGCAEST: gi|100429089|gb|BY977934.1|BY977934
genomic: TTACTTTGATGGGCTTTGGGATGATCCTTACTTCAGCGATGTTGAGCTATgtaagtgcct ... ttggtgccagGTTTATTCACCGCACTTGGATGCTCCACTTCCTCGGTGGGTGCACTTTGCA
EST: TTACTTTGATGGGCTTTGGGATGATCCTTACTTCAGCGATGTTGAGCTAT GTTTATTCACCGCACTTGGATGCTCCACTTCCTCGGTGGGTGCACTTTGCAEST: gi|208363842|gb|DC943299.1|DC943299
genomic: TTACTTTGATGGGCTTTGGGATGATCCTTACTTCAGCGATGTTGAGCTATgtaagtgcct ... ttggtgccagGTTTATTCACCGCACTTGGATGCTCCACTTCCTCGGTGGGTGCACTTTGCA
EST: TGGGCTTTGGGATGATCCTTACTTCAGCGATGTTGAGCTAT GTTTATTCACCGCACTTGGATGCTCCACTTCCTCGGTGGGTGCACTTTGCA
genomic: TGGGCTTTGGGATGATCCTTACTTCAGCGATGTTGAGCTATgtaagtgcct ... ttggtgccagGTTTATTCACCGCACTTGGATGCTCCACTTCCTCGGTGGGTGCACTTTGCA
tggatccagaccgaggatggcatctgatgtaaccttgagaaatgattggtgccagGTTTATTCACCGCACTTGGATGCTCCACTTCCTCGGTGGGTGCACTTTGCACATGGCATCCTTCTCTTTCTTTACCAG
atgtaac putative branch site (score: 5)
aaatgatt TA-rich tract