1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
...ttcaatttagttttttttcttatgttgcataaaattagggaaatgataatcagctgtacatatggtgcgtacttgaatgggtgttgtatggatttctcagGTAACACCAAATTTGTACGGAACCTTGGTAGCTAATACCGCAGCCGGTATTGCAGGCGGCACTGGTGTCATGCCAGGAG
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S212_85V6.2 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CTTGTGTCTAAGCCCCAGCAGTTTGACGTGATG GTAACACCAAATTTGTACGGAACCTTGGTAGCTAATACCGCAGCCGGTATTEST: gi|67698118|gb|BJ958351.1|BJ958351
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EST: ATAACTGCTGTATGCAACTTGTGTCTAAGCCCCAGCAGTTTGACGTGATG GTAACACCAAATTTGTACGGAACCTTGGTAGCTAATACCGCAGCCGGTATTEST: gi|162265636|gb|FC441092.1|FC441092
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ataatcagctgtacatatggtgcgtacttgaatgggtgttgtatggatttctcagGTAACACCAAATTTGTACGGAACCTTGGTAGCTAATACCGCAGCCGGTATTGCAGGCGGCACTGGTGTCATGCCAGGAG
tttctc CT-rich tract
tacatat TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| ttcaatttagttttttttcttatgttgcataaaattagggaaatgataatcagctgtacatatggtgcgtacttgaatgggtgttgtatggatttctcagGTAACACCAAATTTGTACGGAACCTTGGTAGCTAATACCGCAGCCGGTATTGCAGGCGGCACTGGTGTCATGCCAGGAG
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