1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
gtgcgtccccaaagtagggtttcattgtttaagtttctaagccgcattgattaacacaggcacacggtattggaagattttttattttatttttattctttattctttattctgcaaatcacgaaagctttttgagttttatgctttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACCCTTCATCCCAGGGAGGAGATATGATTATGCGCATGATGGCACGTAACT
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S118_166V6.1 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|37829723|gb|BJ587735.1|BJ587735
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162158336|gb|FC334755.1|FC334755
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162275381|gb|FC451565.1|FC451565
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|208366280|gb|DC943826.1|DC943826
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCANTGATTTGCAGCAAGTTACTTNTATGNCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162180630|gb|FC356987.1|FC356987
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162187826|gb|FC364400.1|FC364400
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162182221|gb|FC358236.1|FC358236
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162190966|gb|FC368372.1|FC368372
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162168629|gb|FC343891.1|FC343891
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162172402|gb|FC349071.1|FC349071
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|37845186|gb|BJ603194.1|BJ603194
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|18340882|gb|BJ172913.1|BJ172913
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGNAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162176372|gb|FC353557.1|FC353557
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162167470|gb|FC344187.1|FC344187
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162159445|gb|FC336234.1|FC336234
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTTTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|67693373|gb|BJ953606.1|BJ953606
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: GCGTCCAGTGA-TTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAEST: gi|37831382|gb|BJ589394.1|BJ589394
genomic: GCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCC-AAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGA
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162155562|gb|FC331006.1|FC331006
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162169712|gb|FC345249.1|FC345249
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162152470|gb|FC328033.1|FC328033
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162184364|gb|FC359110.1|FC359110
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162161676|gb|FC339091.1|FC339091
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162274885|gb|FC451120.1|FC451120
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|18333793|gb|BJ165809.1|BJ165809
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|100427420|gb|BY977488.1|BY977488
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162150724|gb|FC327620.1|FC327620
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162208919|gb|FC385263.1|FC385263
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162178715|gb|FC353971.1|FC353971
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162184673|gb|FC361911.1|FC361911
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCCAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCEST: gi|162164618|gb|FC341913.1|FC341913
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162189227|gb|FC366736.1|FC366736
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162166433|gb|FC342415.1|FC342415
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|18339068|gb|BJ171094.1|BJ171094
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162190357|gb|FC365371.1|FC365371
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162191703|gb|FC367436.1|FC367436
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162211065|gb|FC387089.1|FC387089
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGEST: gi|162172403|gb|FC349072.1|FC349072
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAG
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162175125|gb|FC351986.1|FC351986
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|37826525|gb|BJ584537.1|BJ584537
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162196664|gb|FC373810.1|FC373810
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162178139|gb|FC354857.1|FC354857
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162165385|gb|FC340847.1|FC340847
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|19786821|gb|BQ040547.1|BQ040547
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|100390222|gb|BY952630.1|BY952630
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGEST: gi|162178138|gb|FC354856.1|FC354856
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCG
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162175126|gb|FC351987.1|FC351987
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162166870|gb|FC343047.1|FC343047
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|37829114|gb|BJ587126.1|BJ587126
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162196665|gb|FC373811.1|FC373811
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162150525|gb|FC326173.1|FC326173
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|7046842|gb|AW476786.1|AW476786
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162186760|gb|FC362796.1|FC362796
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACEST: gi|162186759|gb|FC362795.1|FC362795
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
EST: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAG ATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
genomic: CGACTGGAGCGTCCAGTGATTTGCAGCAAGTTACTTCTATGGCCAAGCAGgtgcgtcccc ... ttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGAC
tattctttattctgcaaatcacgaaagctttttgagttttatgctttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACCCTTCATCCCAGGGAGGAGATATGATTATGCGCATGATGGCACGTAACT
ctttgttt CT-rich tract
tttttgagttttat TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| gtgcgtccccaaagtagggtttcattgtttaagtttctaagccgcattgattaacacaggcacacggtattggaagattttttattttatttttattctttattctttattctgcaaatcacgaaagctttttgagttttatgctttgtttgcagATGGTCACAGTATTCGGTATGTCAGACATCGGCCCATGGGCTTTGATGGACCCTTCATCCCAGGGAGGAGATATGATTATGCGCATGATGGCACGTAACT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGGAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGAT