1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
...aattgtttccactgttgatagtgaagatcttcatgagctctacgttcttgtacctggttgatgccacgcattattttgatgatatttgtctgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGGTTGTGATGCTGAGAAATAGACTGAAGTATGCCCTGACCTACCGTGAGG
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S38_194V6.1 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ACAAGCTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|162203305|gb|FC379584.1|FC379584
genomic: ACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|162233566|gb|FC410948.1|FC410948
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|162203574|gb|FC379060.1|FC379060
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|162249702|gb|FC426816.1|FC426816
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|67577870|gb|BJ950037.1|BJ950037
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|162272443|gb|FC449069.1|FC449069
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|162258650|gb|FC434345.1|FC434345
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|67578018|gb|BJ950185.1|BJ950185
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|18358480|gb|BJ190539.1|BJ190539
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|162266614|gb|FC441987.1|FC441987
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|18361783|gb|BJ193850.1|BJ193850
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|162207153|gb|FC382475.1|FC382475
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|162180495|gb|FC356137.1|FC356137
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|67578208|gb|BJ950375.1|BJ950375
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|100436063|gb|BY979361.1|BY979361
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|162276836|gb|FC452518.1|FC452518
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|18359386|gb|BJ191447.1|BJ191447
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|67569136|gb|BJ941960.1|BJ941960
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|162277227|gb|FC453657.1|FC453657
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|162258810|gb|FC434817.1|FC434817
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|18329502|gb|BJ161508.1|BJ161508
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|67571902|gb|BJ944726.1|BJ944726
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|18344088|gb|BJ176127.1|BJ176127
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|162272521|gb|FC448511.1|FC448511
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|18329501|gb|BJ161507.1|BJ161507
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|18327151|gb|BJ159152.1|BJ159152
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|18372500|gb|BJ204102.1|BJ204102
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|162261991|gb|FC436824.1|FC436824
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|18328914|gb|BJ160920.1|BJ160920
genomic: GGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|208377280|gb|DC902761.1|DC902761
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|162235887|gb|FC411630.1|FC411630
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|162264651|gb|FC441649.1|FC441649
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|162201548|gb|FC377430.1|FC377430
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|162261992|gb|FC436825.1|FC436825
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|67702402|gb|BJ962635.1|BJ962635
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|18349789|gb|BJ181839.1|BJ181839
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCANACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|18342475|gb|BJ174510.1|BJ174510
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|18350628|gb|BJ182679.1|BJ182679
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|162274060|gb|FC450132.1|FC450132
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|162219346|gb|FC395342.1|FC395342
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|18345618|gb|BJ177661.1|BJ177661
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|18374816|gb|BJ206394.1|BJ206394
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|67576103|gb|BJ948927.1|BJ948927
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|18371782|gb|BJ203384.1|BJ203384
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: NGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|67716696|gb|BJ966956.1|BJ966956
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|18364145|gb|BJ196218.1|BJ196218
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|18332276|gb|BJ164289.1|BJ164289
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|162201160|gb|FC377667.1|FC377667
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|19786886|gb|BQ040554.1|BQ040554
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|162208796|gb|FC384932.1|FC384932
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGEST: gi|162203095|gb|FC380167.1|FC380167
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
EST: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTC GCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
genomic: GGCTCAATGCTCCCAGACATTGGATGCTTGACAAGTTGGGTGGTGCCTTCgtaagttctc ... tgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTG
tcttgtacctggttgatgccacgcattattttgatgatatttgtctgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGGTTGTGATGCTGAGAAATAGACTGAAGTATGCCCTGACCTACCGTGAGG
ttttgat putative branch site (score: 100)
tttgtctgtttctc putative PPT
attattttgatgatat TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| aattgtttccactgttgatagtgaagatcttcatgagctctacgttcttgtacctggttgatgccacgcattattttgatgatatttgtctgtttctcagGCCCCCAAGCCATCTCCTGGACCACACAAGGAAAGGGAATGCTTGCCCTTGGTTGTGATGCTGAGAAATAGACTGAAGTATGCCCTGACCTACCGTGAGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ATGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CTGAAG