1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
gtatgcatgcttaccgcatatacgactgtaattctcccatgcaaatcgagcatgctaacaatcgcgccttgcatttgctaaggtacattgtctgatcaatcatagtactatatacatatcggtcctctgcataatgcgcaaaatctgaaattaggtctggtttatttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGGGGCGGCCGAGGCACACCGGAGTGATGGTGGGCATGGGACAGAAAGACG
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S372_38V6.4 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|67719714|gb|BJ969973.1|BJ969973
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|100379823|gb|BY949962.1|BY949962
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|100409313|gb|BY991949.1|BY991949
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|208355215|gb|DC929732.1|DC929732
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|18356779|gb|BJ188838.1|BJ188838
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|67717930|gb|BJ968189.1|BJ968189
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|100441073|gb|BY980694.1|BY980694
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|208368449|gb|DC939926.1|DC939926
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|162250558|gb|FC428461.1|FC428461
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|100389258|gb|BY971008.1|BY971008
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|100423472|gb|BY958283.1|BY958283
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|208376248|gb|DC940960.1|DC940960
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|67709621|gb|BJ965437.1|BJ965437
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|18328168|gb|BJ160172.1|BJ160172
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|100354831|gb|BY983587.1|BY983587
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|208355826|gb|DC930189.1|DC930189
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|100416011|gb|BY957034.1|BY957034
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|208377765|gb|DC940877.1|DC940877
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|67709704|gb|BJ965520.1|BJ965520
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|18329252|gb|BJ161258.1|BJ161258
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|100395288|gb|BY953662.1|BY953662
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|208347631|gb|DC912862.1|DC912862
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|100388294|gb|BY951896.1|BY951896
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|18358849|gb|BJ190908.1|BJ190908
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGGGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|100415348|gb|BY975271.1|BY975271
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|208373713|gb|DC936540.1|DC936540
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|162173189|gb|FC349243.1|FC349243
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|67717409|gb|BJ967668.1|BJ967668
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|100384225|gb|BY969356.1|BY969356
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|100382526|gb|BY969123.1|BY969123
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|100380171|gb|BY968883.1|BY968883
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|100362829|gb|BY947549.1|BY947549
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|100426497|gb|BY958928.1|BY958928
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|100359852|gb|BY947154.1|BY947154
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|18357607|gb|BJ189666.1|BJ189666
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|100452742|gb|CJ975421.1|CJ975421
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|100398101|gb|BY954088.1|BY954088
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|208375538|gb|DC937025.1|DC937025
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|100403799|gb|BY955107.1|BY955107
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|208349366|gb|DC910411.1|DC910411
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|208375995|gb|DC906738.1|DC906738
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|208362443|gb|DC930976.1|DC930976
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|100424068|gb|BY976649.1|BY976649
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTCTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|100370994|gb|BY985885.1|BY985885
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|100418101|gb|BY993336.1|BY993336
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|67718576|gb|BJ968835.1|BJ968835
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|18330073|gb|BJ162079.1|BJ162079
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|208380056|gb|DC914606.1|DC914606
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|67704070|gb|BJ964303.1|BJ964303
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTEST: gi|67718781|gb|BJ969040.1|BJ969040
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGT
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|100437692|gb|BY979781.1|BY979781
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|208363768|gb|DC931092.1|DC931092
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|100364063|gb|BY966307.1|BY966307
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGACGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|208356473|gb|DC938626.1|DC938626
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|100418766|gb|BY975729.1|BY975729
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|100443303|gb|BY963599.1|BY963599
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|100360875|gb|BY965946.1|BY965946
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|100387494|gb|BY988365.1|BY988365
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|208360561|gb|DC934459.1|DC934459
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|208355467|gb|DC938812.1|DC938812
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|208362628|gb|DC939524.1|DC939524
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCNTGEST: gi|100357187|gb|BY983737.1|BY983737
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|208380404|gb|DC907729.1|DC907729
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|162156866|gb|FC333020.1|FC333020
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGEST: gi|162190721|gb|FC367607.1|FC367607
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCACCATCGEST: gi|100431332|gb|BY960143.1|BY960143
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCG
EST: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAG GCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
genomic: GTGAGGAAGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGCTCTGGAATGGTTAAGgtatgcatgc ... tttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTG
cggtcctctgcataatgcgcaaaatctgaaattaggtctggtttatttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGGGGCGGCCGAGGCACACCGGAGTGATGGTGGGCATGGGACAGAAAGACG
tttattt CT-rich tract
aaaatctgaaatta TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| gtatgcatgcttaccgcatatacgactgtaattctcccatgcaaatcgagcatgctaacaatcgcgccttgcatttgctaaggtacattgtctgatcaatcatagtactatatacatatcggtcctctgcataatgcgcaaaatctgaaattaggtctggtttatttggcgcagGCTGGTTTCGCCGGAGACGATGCCCCCCGGGCTGTTTTCCCCAGCATCGTGGGGCGGCCGAGGCACACCGGAGTGATGGTGGGCATGGGACAGAAAGACG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGTGG