1 5' 3' | 2 5' 3' |
gtttgagtctaatcaattttctgcattaggatttgggtctttctttcgaatgaatttactttccctttttaaagttcttgtatggttttgagaattcaattccttgaccttgtcgaagtaacatccccttcagATTTTCTTGAGGGATATAAATTCGCACCTCCTATCTTGAAGAATTTTAAGTGGTACAATCGCGTCCATATTTCTTCGAATACCTCACTACGTGGATGGCT
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S298_23V6.1 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GTCTCGTACAGTGGACGATCAGACCTGTACCTTTACTTTTTGAATACAAG ATTTTCTTGAGGGATATAAATTCGCACCTCCTATCTTGAAGAATTTTAAGTEST: gi|67726705|gb|BJ976964.1|BJ976964
genomic: GTCTCGTACAGTGGACGATCAGACCTGTACCTTTACTTTTTGAATACAAGgtttgagtct ... tccccttcagATTTTCTTGAGGGATATAAATTCGCACCTCCTATCTTGAAGAATTTTAAGT
EST: GTCTCGTACAGTGGACGATCAGACCTGTACCTTTACTTTTTGAATACAAG ATTTTCTTGAGGGATATAAATTCGCACCTCCTATCTTGAAGAATTTTAAGT
genomic: GTCTCGTACAGTGGACGATCAGACCTGTACCTTTACTTTTTGAATACAAGgtttgagtct ... tccccttcagATTTTCTTGAGGGATATAAATTCGCACCTCCTATCTTGAAGAATTTTAAGT
tgtatggttttgagaattcaattccttgaccttgtcgaagtaacatccccttcagATTTTCTTGAGGGATATAAATTCGCACCTCCTATCTTGAAGAATTTTAAGTGGTACAATCGCGTCCATATTTCTTCGAATACCTCACTACGTGGATGGCT
aagtaac putative branch site (score: 2)
catccccttc CT-rich tract
aattcaatt TA-rich tract