Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtaggacctcgttaaacgaacttcttttgtgctcaattttaattcgcttccccctgagagccattggttcttcagcgaaatctagcgtaaaacacttctaactagtgttattgttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACTGAGGCAGATCTTCAATGGCGTGTTCATGAAGGTGAACAAGGCCACCGTG

Basic information

species Physcomitrella patens
transcript PP1S243_40V6.1
intron # 2
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: PP1S243_40V6.1 (Physcomitrella patens), 3'ss of exon 2
lower sequence: EFJ20182 (Selaginella moellendorffii), 3'ss of exon 3
gtaggacctcgttaaacgaacttcttttgtgctcaattttaattcgcttccccctgagagccattggttcttcagcgaaatctagcgtaaaacacttctaactagtgttattgttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACTGAGGCAGATCTTCAATGGCGTGTTCATGAAGGTGAACAAGGCCACCGTG
                                           |   ||||   ||| |||    | || |  | |||  |||    | |       ||| |  ||  | |  || ||  |   ||||||   ||  |  |||||| |  |||     ||| | || || |            |  |   |   ||   | | ||                 
------------------------------------------gtaaattccttgtgaaagctgc-gattgtgaaacgagttct---ctga-------ctatcacgttctttcttttatagATCTTCAATGGGGTGTTCATGAAGGTGAACAAG-----GCAACCATGAACATGCTCAAGAGAGTCGAGCCGTACGTGACTTACGG-----------------

upper sequence: PP1S243_40V6.1 (Physcomitrella patens), 3'ss of exon 2
lower sequence: EFJ23123 (Selaginella moellendorffii), 3'ss of exon 3
gtaggacctcgttaaacgaacttcttttgtgctcaattttaattcgcttccccctgagagccattggttcttcagcgaaatctagcgtaaaacacttctaactagtgttattgttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACTGAGGCAGATCTTCAATGGCGTGTTCATGAAGGTGAACAAGGCCACCGTG
                                           |   ||||   ||| ||     | || |    |||  |||      |      ||  | |  |  | || | ||||     ||||||   ||  |  |||||| |  |||     ||| | || || |            |  |   |   ||   | | ||                 
------------------------------------------gtaaattccttgtgaaagttgc-gattgtgatacgagttctcttacta------tcacattctttcttttatagATCT----TCAATGGGGTGTTCATGAAGGTGAACAAG-----GCAACCATGAACATGCTCAAGAGAGTCGAGCCGTACGTGACTTACGG-----------------
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|67719576|gb|BJ969835.1|BJ969835
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|18354595|gb|BJ186652.1|BJ186652
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|67575003|gb|BJ947827.1|BJ947827
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|18338215|gb|BJ170239.1|BJ170239
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|100429258|gb|BY978020.1|BY978020
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|67728253|gb|BJ978512.1|BJ978512
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|67703599|gb|BJ963832.1|BJ963832
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCCAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACA
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACA
EST: gi|67718791|gb|BJ969050.1|BJ969050
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|37831596|gb|BJ589608.1|BJ589608
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|37827416|gb|BJ585428.1|BJ585428
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCTTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|162240328|gb|FC414334.1|FC414334
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|208366644|gb|DC955664.1|DC955664
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|162258509|gb|FC434724.1|FC434724
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|162204110|gb|FC378868.1|FC378868
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|18345231|gb|BJ177272.1|BJ177272
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|208390082|gb|DC942383.1|DC942383
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|208371496|gb|DC931847.1|DC931847
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|37832950|gb|BJ590962.1|BJ590962
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|162226005|gb|FC400997.1|FC400997
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|162226004|gb|FC400996.1|FC400996
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|208349223|gb|DC906365.1|DC906365
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|208390913|gb|DC942231.1|DC942231
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|18348049|gb|BJ180096.1|BJ180096
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|162224783|gb|FC400783.1|FC400783
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|67719994|gb|BJ970253.1|BJ970253
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|162224383|gb|FC399577.1|FC399577
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|18363173|gb|BJ195245.1|BJ195245
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|162209843|gb|FC385985.1|FC385985
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTACGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|37840388|gb|BJ598396.1|BJ598396
EST:     TCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGAC
genomic: TCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTAT-CCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGAC
EST: gi|18356006|gb|BJ188065.1|BJ188065
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|162158525|gb|FC334528.1|FC334528
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|67698439|gb|BJ958672.1|BJ958672
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|208367342|gb|DC951274.1|DC951274
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|162279197|gb|FC455744.1|FC455744
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|37827803|gb|BJ585815.1|BJ585815
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|162240288|gb|FC414333.1|FC414333
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|18349088|gb|BJ181137.1|BJ181137
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGATT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|162224784|gb|FC400784.1|FC400784
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|162211019|gb|FC387325.1|FC387325
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|208351910|gb|DC917957.1|DC917957
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|162213018|gb|FC389234.1|FC389234
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|208391610|gb|DC938223.1|DC938223
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|37822885|gb|BJ580951.1|BJ580951
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|162239562|gb|FC416844.1|FC416844
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|162258510|gb|FC434725.1|FC434725
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|67727162|gb|BJ977421.1|BJ977421
EST:     TTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|6102389|gb|AW126859.1|AW126859
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|162169567|gb|FC346131.1|FC346131
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|15728045|gb|BI740592.1|BI740592
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|18343689|gb|BJ175727.1|BJ175727
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|162229084|gb|FC404768.1|FC404768
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|18353613|gb|BJ185668.1|BJ185668
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|67727844|gb|BJ978103.1|BJ978103
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|67719938|gb|BJ970197.1|BJ970197
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|37851054|gb|BJ609062.1|BJ609062
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGGGCATAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|162204111|gb|FC378869.1|FC378869
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|67718367|gb|BJ968626.1|BJ968626
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|18359615|gb|BJ191676.1|BJ191676
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|67717748|gb|BJ968007.1|BJ968007
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|208368469|gb|DC955122.1|DC955122
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|162279196|gb|FC455743.1|FC455743
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|67726255|gb|BJ976514.1|BJ976514
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|208359472|gb|DC954025.1|DC954025
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|67716470|gb|BJ966730.1|BJ966730
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|208395630|gb|DC920248.1|DC920248
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|162272132|gb|FC447926.1|FC447926
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|162201512|gb|FC377420.1|FC377420
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|37851852|gb|BJ609860.1|BJ609860
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|162158524|gb|FC334527.1|FC334527
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|18331456|gb|BJ163467.1|BJ163467
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|67702144|gb|BJ962377.1|BJ962377
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAA
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAA
EST: gi|67727903|gb|BJ978162.1|BJ978162
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|162272133|gb|FC447927.1|FC447927
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|37830598|gb|BJ588610.1|BJ588610
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|15729049|gb|BI741111.1|BI741111
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|67727001|gb|BJ977260.1|BJ977260
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|208393437|gb|DC904055.1|DC904055
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|37835085|gb|BJ593097.1|BJ593097
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|162229083|gb|FC404767.1|FC404767
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|67704657|gb|BJ964890.1|BJ964890
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|208353573|gb|DC946353.1|DC946353
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|208391325|gb|DC942125.1|DC942125
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|67702073|gb|BJ962306.1|BJ962306
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAG
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAG
EST: gi|208367956|gb|DC955377.1|DC955377
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|162274794|gb|FC450834.1|FC450834
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|67704191|gb|BJ964424.1|BJ964424
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCA
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCA
EST: gi|67720639|gb|BJ970898.1|BJ970898
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|37840630|gb|BJ598638.1|BJ598638
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|18354986|gb|BJ187045.1|BJ187045
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|67703217|gb|BJ963450.1|BJ963450
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|162211020|gb|FC387326.1|FC387326
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|162213019|gb|FC389235.1|FC389235
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|67719637|gb|BJ969896.1|BJ969896
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|18330393|gb|BJ162399.1|BJ162399
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|67720379|gb|BJ970638.1|BJ970638
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|18363494|gb|BJ195566.1|BJ195566
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|162259268|gb|FC436185.1|FC436185
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|37824594|gb|BJ582660.1|BJ582660
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|37836057|gb|BJ594065.1|BJ594065
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGATT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|67720565|gb|BJ970824.1|BJ970824
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|162209842|gb|FC385984.1|FC385984
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|18351246|gb|BJ183298.1|BJ183298
EST:     TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TTCTATGTCGAGCCAGAGCCTAAGCTTATGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
EST: gi|18341405|gb|BJ173440.1|BJ173440
EST:     TGTTTGTCATCCGTATCCGTGG                         TATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT
genomic: TGTTTGTCATCCGTATCCGTGGgtaggacctc ... gttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACT


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

ttcttcagcgaaatctagcgtaaaacacttctaactagtgttattgttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACTGAGGCAGATCTTCAATGGCGTGTTCATGAAGGTGAACAAGGCCACCGTG
                                        ttattgtt  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
gtaggacctcgttaaacgaacttcttttgtgctcaattttaattcgcttccccctgagagccattggttcttcagcgaaatctagcgtaaaacacttctaactagtgttattgttgatccagTATCAATGACATGCACCCGAAGGTCAGGAAGATCATGCAGCTATTAAGACTGAGGCAGATCTTCAATGGCGTGTTCATGAAGGTGAACAAGGCCACCGTG

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCAGAT