1 5' 3' | 2 5' 3' |
gtatgatattaactgttttgatgatgcatttgtattctccctatgtgatgaagtggcttgcaataaaatgcagttctaaagcatgtcatgggccaagctgggtcgttatcgtcttcttcacatcgtggtatctctgtgatcggcacaaaacctaaaatgttggtattgtgcggattttatgcagGCTGGTTTCGCTGGAGATGACGCCCCCCGCGCCGTGTTTCCGAGCATCGTGGGACGGCCGAGGCACACTGGTGTGATGGTCGGTATGGGACAGAAGGACG
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S198_157V6.3 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GTGAGGATGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGATCCGGAATGGTGAAG GCTGGTTTCGCTGGAGATGACGCCCCCCGCGCCGTGTTTCCGAGCATCGTGEST: gi|18366967|gb|BJ199047.1|BJ199047
genomic: GTGAGGATGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGATCCGGAATGGTGAAGgtatgatatt ... ttttatgcagGCTGGTTTCGCTGGAGATGACGCCCCCCGCGCCGTGTTTCCGAGCATCGTG
EST: GTGAGGATGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGATCCGGAATGGTGAAG GCTGGNTTCGCTGGAGATGACGCCCCCCGCGCCGTGTTTCCGAGCATCGTGEST: gi|208389210|gb|DC933238.1|DC933238
genomic: GTGAGGATGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGATCCGGAATGGTGAAGgtatgatatt ... ttttatgcagGCTGGTTTCGCTGGAGATGACGCCCCCCGCGCCGTGTTTCCGAGCATCGTG
EST: GTGAGGATGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGATCCGGAATGGTGAAG GCTGGTTTCGCTGGAGATGACGCCCCCCGCGCCGTGTTTCCGAGCATCGTG
genomic: GTGAGGATGTCCAGCCTTTGGTGTGCGACAATGGATCCGGAATGGTGAAGgtatgatatt ... ttttatgcagGCTGGTTTCGCTGGAGATGACGCCCCCCGCGCCGTGTTTCCGAGCATCGTG
atctctgtgatcggcacaaaacctaaaatgttggtattgtgcggattttatgcagGCTGGTTTCGCTGGAGATGACGCCCCCCGCGCCGTGTTTCCGAGCATCGTGGGACGGCCGAGGCACACTGGTGTGATGGTCGGTATGGGACAGAAGGACG
acctaaa putative branch site (score: 3)
taaaatgtt TA-rich tract