1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
gtattcttactacttctttcctccaactgattaacttctttgtagttgtttggatgaagaacgcagctgcaagtttagcggtgtgttttaaccaatattttctaattttgactggtatgtctcgtaacattttgagtatggcagatttgttaaatctgtttgtggtaaaactgactgttgtaagacgtgtttgctcagCAAAAGAGCATGTGGTGGGGTGGTACAGCACTGGGCCTAAGCTTCGAGAAAATGATCTTGACATTAATGAGCTATTTCGGGA
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S197_115V6.1 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GGACCACAACTATCATGAGACTATGTTCGACATGTTCAAGAGAATTAACG CAAAAGAGCATGTGGTGGGGTGGTACAGCACTGGGCCTAAGCTTCGAGAAAEST: gi|100442139|gb|BY963032.1|BY963032
genomic: GGACCACAACTATCATGAGACTATGTTCGACATGTTCAAGAGAATTAACGgtattcttac ... gtttgctcagCAAAAGAGCATGTGGTGGGGTGGTACAGCACTGGGCCTAAGCTTCGAGAAA
EST: GGACCACAACTATCATGAGACTATGTTCGACATGTTCAAGAGAATTAGCG CAAAAGAGCATGTGGTGGGGTGGTACAGCACTGGGCCTAAGTTTCGAGAAAEST: gi|18346971|gb|BJ179017.1|BJ179017
genomic: GGACCACAACTATCATGAGACTATGTTCGACATGTTCAAGAGAATTAACGgtattcttac ... gtttgctcagCAAAAGAGCATGTGGTGGGGTGGTACAGCACTGGGCCTAAGCTTCGAGAAA
EST: GGACCACAACTATCATGAGACTATGTTCGACATGTTCAAGAGAATTAACG CAAAAGAGCATGTGGTGGGGTGGTACAGCACTGGEST: gi|208368978|gb|DC955063.1|DC955063
genomic: GGACCACAACTATCATGAGACTATGTTCGACATGTTCAAGAGAATTAACGgtattcttac ... gtttgctcagCAAAAGAGCATGTGGTGGGGTGGTACAGCACTGG
EST: GGACCACAACTATCATGAGACTATGTTCGACATGTTCAAGAGAATTAACG CAAAAGAGCATGTGGTGGGGTGGTACAGCACTGGGCCTAAGCTTCGAGAAAEST: gi|208391154|gb|DC942066.1|DC942066
genomic: GGACCACAACTATCATGAGACTATGTTCGACATGTTCAAGAGAATTAACGgtattcttac ... gtttgctcagCAAAAGAGCATGTGGTGGGGTGGTACAGCACTGGGCCTAAGCTTCGAGAAA
EST: GGACCACAACTATCATGAGACTATGTTCGACATGTTCAAGAGAATTAACG CAAAAGAGCATGTGGTGGGGTGGTACAGCACTGGGCCTAAGCTTCGAGAAAEST: gi|100398742|gb|BY990493.1|BY990493
genomic: GGACCACAACTATCATGAGACTATGTTCGACATGTTCAAGAGAATTAACGgtattcttac ... gtttgctcagCAAAAGAGCATGTGGTGGGGTGGTACAGCACTGGGCCTAAGCTTCGAGAAA
EST: GGACCACAACTATCATGAGACTATGTTCGACATGTTCAAGAGAATTAACG CAAAAGAGCATGTGGTGGGGTGGTACAGCACTGGGCCTAAGCTTCGAGAAAEST: gi|100426796|gb|BY977367.1|BY977367
genomic: GGACCACAACTATCATGAGACTATGTTCGACATGTTCAAGAGAATTAACGgtattcttac ... gtttgctcagCAAAAGAGCATGTGGTGGGGTGGTACAGCACTGGGCCTAAGCTTCGAGAAA
EST: GGACCACAACTATCATGAGACTATGTTCGACATGTTCAAGAGAATTAACG CAAAAGAGCATGTGGTGGGGTGGTACAGCACTGGGCCTAAGCTTCGAGAAAEST: gi|100362914|gb|BY947592.1|BY947592
genomic: GGACCACAACTATCATGAGACTATGTTCGACATGTTCAAGAGAATTAACGgtattcttac ... gtttgctcagCAAAAGAGCATGTGGTGGGGTGGTACAGCACTGGGCCTAAGCTTCGAGAAA
EST: GGACCACAACTATCATGAGACTATGTTCGACATGTTCAAGAGAATTAACG CANAAGAGCATGTGGTGGGGTGGTACAGCACTGGGCCTAAGCTTCGAGAAAEST: gi|100387742|gb|BY951742.1|BY951742
genomic: GGACCACAACTATCATGAGACTATGTTCGACATGTTCAAGAGAATTAACGgtattcttac ... gtttgctcagCAAAAGAGCATGTGGTGGGGTGGTACAGCACTGGGCCTAAGCTTCGAGAAA
EST: GGACCACAACTATCATGAGACTATGTTCGACATGTTCAAGAGAATTAACG CANAAGAGCATGTGGTGGGGTGGTACAGCACTGGGCCTAAGCTTCGAGAAAEST: gi|100381366|gb|BY950092.1|BY950092
genomic: GGACCACAACTATCATGAGACTATGTTCGACATGTTCAAGAGAATTAACGgtattcttac ... gtttgctcagCAAAAGAGCATGTGGTGGGGTGGTACAGCACTGGGCCTAAGCTTCGAGAAA
EST: GGACCACAACTATCATGAGACTATGTTCGACATGTTCAAGAGAATTAACG CAAAAGAGCATGTGGTGGGGTGGTACAGCACTGGGCCTAAGCTTCGAGAAAEST: gi|208361519|gb|DC942804.1|DC942804
genomic: GGACCACAACTATCATGAGACTATGTTCGACATGTTCAAGAGAATTAACGgtattcttac ... gtttgctcagCAAAAGAGCATGTGGTGGGGTGGTACAGCACTGGGCCTAAGCTTCGAGAAA
EST: GGACCACAACTATCATGAGACTATGTTCGACATGTTCAAGAGAATTAACG CAAAAGAGCATGTGGTGGGGTGGTACAGCACTGGGCCTAAGCTTCGAGAAA
genomic: GGACCACAACTATCATGAGACTATGTTCGACATGTTCAAGAGAATTAACGgtattcttac ... gtttgctcagCAAAAGAGCATGTGGTGGGGTGGTACAGCACTGGGCCTAAGCTTCGAGAAA
gatttgttaaatctgtttgtggtaaaactgactgttgtaagacgtgtttgctcagCAAAAGAGCATGTGGTGGGGTGGTACAGCACTGGGCCTAAGCTTCGAGAAAATGATCTTGACATTAATGAGCTATTTCGGGA
aactgac putative branch site (score: 2)
tttgctc putative PPT
ttaaatct TA-rich tract