Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...atgagcatcgtgctgctttcacgagaagtccttctgtatacatccacaattttctctttatttactgttggctgatgaattccacttggttctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCGATGAAGCTCCCCAAGTAGAGGAGAAGAAG

Basic information

species Physcomitrella patens
transcript PP1S152_152V6.1
intron # 2
splice site 3'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|162214781|gb|FC391852.1|FC391852
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|67716324|gb|BJ966584.1|BJ966584
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162274346|gb|FC450314.1|FC450314
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162273071|gb|FC447765.1|FC447765
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162267478|gb|FC444229.1|FC444229
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|67717378|gb|BJ967637.1|BJ967637
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTTATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|18355607|gb|BJ187666.1|BJ187666
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGCGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162234300|gb|FC409838.1|FC409838
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|18369120|gb|BJ201205.1|BJ201205
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|67709626|gb|BJ965442.1|BJ965442
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162275906|gb|FC451467.1|FC451467
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162201887|gb|FC376885.1|FC376885
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|18370169|gb|BJ201771.1|BJ201771
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162237278|gb|FC413853.1|FC413853
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162218542|gb|FC395119.1|FC395119
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162278158|gb|FC454393.1|FC454393
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|18327778|gb|BJ159782.1|BJ159782
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|7147747|gb|AW509612.1|AW509612
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162271027|gb|FC446080.1|FC446080
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|67724838|gb|BJ975097.1|BJ975097
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|18334750|gb|BJ166767.1|BJ166767
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|19781597|gb|BQ039747.1|BQ039747
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|7583253|gb|AW699417.1|AW699417
EST:     CAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: CAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162190459|gb|FC365681.1|FC365681
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162218541|gb|FC395118.1|FC395118
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|22492450|gb|BU052373.1|BU052373
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|67703654|gb|BJ963887.1|BJ963887
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|67724425|gb|BJ974684.1|BJ974684
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|7047488|gb|AW477382.1|AW477382
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|19775970|gb|BQ039036.1|BQ039036
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|67704217|gb|BJ964450.1|BJ964450
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|67723701|gb|BJ973960.1|BJ973960
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162199916|gb|FC376183.1|FC376183
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|67712713|gb|BJ966162.1|BJ966162
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162236016|gb|FC412175.1|FC412175
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|67701702|gb|BJ961935.1|BJ961935
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|208361091|gb|DC946710.1|DC946710
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162228236|gb|FC404952.1|FC404952
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|7067016|gb|AW496871.1|AW496871
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162244892|gb|FC423524.1|FC423524
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|208378939|gb|DC922785.1|DC922785
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162203722|gb|FC378597.1|FC378597
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAAGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|208356900|gb|DC922264.1|DC922264
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|67725939|gb|BJ976198.1|BJ976198
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|7047310|gb|AW477204.1|AW477204
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162263631|gb|FC440115.1|FC440115
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|37848382|gb|BJ606390.1|BJ606390
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|67720188|gb|BJ970447.1|BJ970447
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|37844608|gb|BJ602616.1|BJ602616
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162213489|gb|FC389361.1|FC389361
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|208347576|gb|DC912835.1|DC912835
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|67725894|gb|BJ976153.1|BJ976153
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTTATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162278458|gb|FC454544.1|FC454544
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162208792|gb|FC384928.1|FC384928
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162207894|gb|FC383600.1|FC383600
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162279408|gb|FC455524.1|FC455524
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|7647921|gb|AW738904.1|AW738904
EST:     CACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: CACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|18340240|gb|BJ172268.1|BJ172268
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162278457|gb|FC454543.1|FC454543
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162266922|gb|FC443023.1|FC443023
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCTTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|208377669|gb|DC932205.1|DC932205
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162191539|gb|FC368465.1|FC368465
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|18338284|gb|BJ170308.1|BJ170308
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGTTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|67693806|gb|BJ954039.1|BJ954039
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162205858|gb|FC381096.1|FC381096
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162266923|gb|FC443024.1|FC443024
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|67717969|gb|BJ968228.1|BJ968228
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|208398151|gb|DC908380.1|DC908380
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162213490|gb|FC389362.1|FC389362
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|18367838|gb|BJ199921.1|BJ199921
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|37832549|gb|BJ590561.1|BJ590561
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGCGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|67726472|gb|BJ976731.1|BJ976731
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|18342585|gb|BJ174620.1|BJ174620
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|67717422|gb|BJ967681.1|BJ967681
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162206330|gb|FC382608.1|FC382608
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162240015|gb|FC418805.1|FC418805
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162263630|gb|FC440114.1|FC440114
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|18374068|gb|BJ205646.1|BJ205646
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|37850992|gb|BJ609000.1|BJ609000
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162217198|gb|FC392562.1|FC392562
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162222572|gb|FC398723.1|FC398723
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|208354434|gb|DC926611.1|DC926611
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162217197|gb|FC392561.1|FC392561
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|37821730|gb|BJ579796.1|BJ579796
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162206354|gb|FC382632.1|FC382632
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|67570523|gb|BJ943347.1|BJ943347
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162206512|gb|FC382881.1|FC382881
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
EST: gi|162275907|gb|FC451468.1|FC451468
EST:     GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTG                         GTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG
genomic: GCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCG

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 1 RNA-Seqlibrary.


Block sizes: 35 (upstream exon), 35 (downstream exon)
Score: 80

AAGGCTGCCAACGTTTCAGTTGAGGGCTACTGGCCTTCGCTTTTCGCCAAGCTGTGCGAGAAGAGGAGCGTTGATGATCTCATCACCAATGTCGGAGGTGgtaagtgttg ... tctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCGATGAAGCTCCCCAAGTAGAGGAGAAGAAG




<











<


<











 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

acaattttctctttatttactgttggctgatgaattccacttggttctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCGATGAAGCTCCCCAAGTAGAGGAGAAGAAG
                        ggctgat  putative branch site (score: 80)
                                            ttctcat  putative PPT
     tttctctttattta  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
atgagcatcgtgctgctttcacgagaagtccttctgtatacatccacaattttctctttatttactgttggctgatgaattccacttggttctcatgtagGTGGTGGTGCTGCCGTCGCTGTGAGCGCTGCACCTGCTTCCTCGGCTGCCGATGAAGCTCCCCAAGTAGAGGAGAAGAAG

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGAAGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AGAGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AGGAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAAG
- - - - - tgctgct