Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   
2  
 5'  3'   
3  
 5'  3'   
4  
 5'  3'   
5  
 5'  3'   
6  
 5'  3'   
7  
 5'  3'   
8  
 5'  3'   
9  
 5'  3'   
10  
 5'  3'   
11  
 5'  3'   
12  
 5'  3'   
13  
 5'  3'   
14  
 5'  3'   
15  
 5'  3'   
16  
 5'  3'   
17  
 5'  3'   
18  
 5'  3'   
19  
 5'  3'   
20  
 5'  3'   
21  
 5'  3'   
22  
 5'  3'   
23  
 5'  3'   
24  
 5'  3'   
25  
 5'  3'   
26  
 5'  3'   
27  
 5'  3'   
28  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...gtcattgcaccttccttgtagtttcccataatctgttcagtacatatttatgatataccatttttaatttttgaatattgaattttgttggctctgtcagATTGTAGTATATCTTACATCATTCATGGAAGATGTACGACCCCTTGTGCGAAGTATATCATGTTGGACTCTTTCTCGCTACAGCGAATGGATTGTTAAG

Basic information

species Physcomitrella patens
transcript PP1S14_82V6.1
intron # 13
splice site 3'
intron type U2


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

atttatgatataccatttttaatttttgaatattgaattttgttggctctgtcagATTGTAGTATATCTTACATCATTCATGGAAGATGTACGACCCCTTGTGCGAAGTATATCATGTTGGACTCTTTCTCGCTACAGCGAATGGATTGTTAAG
                ttttaat  putative branch site (score: 3)
 ctctgtc  putative PPT
 atataccatttttaat  TA-rich tract