1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' |
gtaatctttcagtgctgcttcccgccttgcatagaagctgataaaaatgcaaggtttttggctatcttgtaagcatgctcttgctttttgcaacactaacatctattcgtatatgaatgtgacagGAGGGTACTGCAAATTATTTTAAGGGTTTAATGCTGATTCTTTGCTACTTGATAGTTGGTGCCAGCTTCTTTGTTCATGTCGACATTCCAGACAAGCATC
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S21_141V6.2 |
intron # | 10 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AACTGCGACACTTATTCATAACAGTTCTAGTGGTTGCTTTGATGCTTCAG GAGGGTACTGCAAATTATTTTAAGGGTTTAATGCTGATTCTTTGCTACTTGEST: gi|100420664|gb|BY993453.1|BY993453
genomic: AACTGCGACAC-TATTCATAACAGTTCTAGTGGTTGCTTTGATGCTTCAGgtaatctttc ... aatgtgacagGAGGGTACTGCAAATTATTTTAAGGGTTTAATGCTGATTCTTTGCTACTTG
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aagcatgctcttgctttttgcaacactaacatctattcgtatatgaatgtgacagGAGGGTACTGCAAATTATTTTAAGGGTTTAATGCTGATTCTTTGCTACTTGATAGTTGGTGCCAGCTTCTTTGTTCATGTCGACATTCCAGACAAGCATC
cactaac putative branch site (score: 1)
tatatgaat TA-rich tract