1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
gtaatttctcttctttttatattatactcaatgtgcgtggagcctgcgctttgggagtttttaagatgtaaaaaatagtataacagacgccatatactaattggttcatgtttgcagGGTCTACAGCTGCTTACAGCAATTGGTGCCGTTTACTTCAAAGTAGCTTAATTGTTGTCAAGTTCTCTCACATTCGTCTGCGCAAATTTTAGTTCCAGCA
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S78_210V6.1 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTGAGTTTGTACCAAGTTGGGAATTATGGATTCCTTGAGTGCGAATCATG GGTCTACAGCTGCTTACAGCAATTGGTGCCGTTTACTTCAAAGTAGCTTAA
genomic: TTGAGTTTGTACCAAGTTGGGAATTATGGATTCCTTGAGTGCGAATCATGgtaatttctc ... atgtttgcagGGTCTACAGCTGCTTACAGCAATTGGTGCCGTTTACTTCAAAGTAGCTTAA
aagatgtaaaaaatagtataacagacgccatatactaattggttcatgtttgcagGGTCTACAGCTGCTTACAGCAATTGGTGCCGTTTACTTCAAAGTAGCTTAATTGTTGTCAAGTTCTCTCACATTCGTCTGCGCAAATTTTAGTTCCAGCA
tactaat putative branch site (score: 6)
taaaaaatagtataac TA-rich tract