1 5' 3' | 2 5' 3' |
...ataacagcgatgttgggcaccccactttcgagtgcctcatctaggatatggcctcgaaattcctagatatgaataaaatggtgaaggtttttgcgcgcagGCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCATGGGTGTGATGCGGCCCGAGCTGGTGATGAAGTCGATCGTACCAGTGGT
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S45_97V6.1 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCAT GCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCAEST: gi|208400226|gb|DC908887.1|DC908887
genomic: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCATgtatggactc ... ttgcgcgcagGCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCA
EST: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCAT GCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCAEST: gi|67507827|gb|BJ940704.1|BJ940704
genomic: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCATgtatggactc ... ttgcgcgcagGCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCA
EST: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCAT GCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCAEST: gi|100432293|gb|BY960411.1|BY960411
genomic: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCATgtatggactc ... ttgcgcgcagGCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCA
EST: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCAT GCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCAEST: gi|100352656|gb|BY945381.1|BY945381
genomic: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCATgtatggactc ... ttgcgcgcagGCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCA
EST: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCAT GCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCAEST: gi|19790121|gb|BQ041643.1|BQ041643
genomic: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCATgtatggactc ... ttgcgcgcagGCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCA
EST: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCAT GCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCAEST: gi|162206392|gb|FC383385.1|FC383385
genomic: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCATgtatggactc ... ttgcgcgcagGCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCA
EST: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCAT GCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCAEST: gi|67718832|gb|BJ969091.1|BJ969091
genomic: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCATgtatggactc ... ttgcgcgcagGCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCA
EST: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCAT GCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCAEST: gi|100372520|gb|BY985638.1|BY985638
genomic: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCATgtatggactc ... ttgcgcgcagGCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCA
EST: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCAT GCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCAEST: gi|67568945|gb|BJ941769.1|BJ941769
genomic: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCATgtatggactc ... ttgcgcgcagGCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCA
EST: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCAT GCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCAEST: gi|208355821|gb|DC930184.1|DC930184
genomic: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCATgtatggactc ... ttgcgcgcagGCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCA
EST: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCAT GCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCAEST: gi|208388958|gb|DC932986.1|DC932986
genomic: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCATgtatggactc ... ttgcgcgcagGCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCA
EST: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCAT GCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCAEST: gi|18354664|gb|BJ186722.1|BJ186722
genomic: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCATgtatggactc ... ttgcgcgcagGCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCA
EST: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCAT GCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCAEST: gi|208348535|gb|DC905814.1|DC905814
genomic: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCATgtatggactc ... ttgcgcgcagGCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCA
EST: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCAT GCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCAEST: gi|18351281|gb|BJ183333.1|BJ183333
genomic: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCATgtatggactc ... ttgcgcgcagGCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCA
EST: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCAT GCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCAEST: gi|100417075|gb|BY957154.1|BY957154
genomic: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCATgtatggactc ... ttgcgcgcagGCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCA
EST: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCAT GCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCAEST: gi|18354638|gb|BJ186696.1|BJ186696
genomic: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCATgtatggactc ... ttgcgcgcagGCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCA
EST: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCAT GCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCAEST: gi|67575975|gb|BJ948799.1|BJ948799
genomic: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCATgtatggactc ... ttgcgcgcagGCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCA
EST: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCAT GCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCA
genomic: CGCTCCCTTCTTCGGCTTCATTGGAGCTGCAGCTGCTCTCGTCTTCTCATgtatggactc ... ttgcgcgcagGCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCA
atatggcctcgaaattcctagatatgaataaaatggtgaaggtttttgcgcgcagGCATGGGCGCTGCATATGGAACAGCCAAGAGTGGAGTGGGAGTGGCATCCATGGGTGTGATGCGGCCCGAGCTGGTGATGAAGTCGATCGTACCAGTGGT
tttttgc CT-rich tract
tagatatgaataaaat TA-rich tract