Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtagctatgctgacccctaaatctagaattgtggccaatgttctctaaaacttatcaccagttccacatgttcatctgattgattgactgtcaactgaatctgaaacttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGTCCAAATTACCAAACTGGGCTGGCTAAAATGCGCAAGCTTGGCGCAGAAC

Basic information

species Oryza sativa
transcript LOC_Os11g47330.1
intron # 9
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: LOC_Os11g47330.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 9
lower sequence: GRMZM2G107082_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 9
gtagctatgctgacccctaaatctagaattgtggccaatgttctctaaaacttatcaccagttccacatgttcatctgattgattgactgtcaactgaatc----tgaaacttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGTCCAAATTACCAAACTGGGCTGGCTAAAATGCGCAAGCTTGGCGCAGAAC
||| ||| |   ||| || | | ||||||  |  |   ||          |||  ||||| |   |  |||||| || |||||||      |   |  |||       || |  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||
gtacctaag---accactcactttagaatcctcactggtg----------cttggcaccactcatatctgttcacctaattgattcttcacctgttttatcgccacacaattcactttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTTCAAGAATGCACATTTATGTCCGCCGAGGTGGTCCAAATTACCAATCTGGACTGGCTAAAATGCGTAAGCTTGGTGCAGAAC
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|87026947|gb|CI259600.1|CI259600
EST:     CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|89167861|gb|CI021560.1|CI021560
EST:     CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|86434803|gb|CI106036.1|CI106036
EST:     CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|86536928|gb|CI177134.1|CI177134
EST:     CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|88993356|gb|CI257784.1|CI257784
EST:     CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|89173357|gb|CI041250.1|CI041250
EST:     CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAAGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|88304259|gb|CI515532.1|CI515532
EST:     TTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: TTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|29623682|gb|CB628693.1|CB628693
EST:     CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|15854608|gb|BI807420.1|BI807420
EST:     TAAGAGAGAAG                         GAATCCACA-TTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGG
genomic: TAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCA-AGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGG
EST: gi|88220355|gb|CI219915.1|CI219915
EST:     CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|89194489|gb|CI116926.1|CI116926
EST:     CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCCAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|89195503|gb|CI051616.1|CI051616
EST:     CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|86871193|gb|CI328395.1|CI328395
EST:     CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|86418647|gb|CI053448.1|CI053448
EST:     CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|89169878|gb|CI110237.1|CI110237
EST:     CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGCCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|14981637|gb|BI306315.1|BI306315
EST:     GGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: GGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|89185634|gb|CI047503.1|CI047503
EST:     CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|88843098|gb|CI371998.1|CI371998
EST:     CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTC-GGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACTTGTTGGT
genomic: CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|86528348|gb|CI168554.1|CI168554
EST:     CCGACGTCGGGTCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|8856181|gb|AU093499.1|AU093499
EST:     CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|89193655|gb|CI116288.1|CI116288
EST:     CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCCAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|29687148|gb|CB683423.1|CB683423
EST:     CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|33671920|gb|CF300159.1|CF300159
EST:     CATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: CATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|88840778|gb|CI080232.1|CI080232
EST:     CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|88976891|gb|CI257587.1|CI257587
EST:     CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|88993379|gb|CI257807.1|CI257807
EST:     CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|86893933|gb|CI314922.1|CI314922
EST:     CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGCCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|86868810|gb|CI334182.1|CI334182
EST:     ATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: ATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|88988022|gb|CI018065.1|CI018065
EST:     CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|29667083|gb|CB663358.1|CB663358
EST:     CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|86837511|gb|CI345722.1|CI345722
EST:     CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|86488927|gb|CI131560.1|CI131560
EST:     CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|88481337|gb|CI418608.1|CI418608
EST:     CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|88960097|gb|CI381975.1|CI381975
EST:     CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|88994381|gb|CI117335.1|CI117335
EST:     CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|27920666|gb|CB096474.1|CB096474
EST:     CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
genomic: CCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGT
EST: gi|88995393|gb|CI036968.1|CI036968
EST:     TTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAG                         GAATCCAAGTTGAAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGG
genomic: TTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTG-AAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGG

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 1 RNA-Seqlibrary.


Block sizes: 68 (upstream exon), 73 (downstream exon)
Score: 86

TGATGGCCGCAAGAGAGCTCTTCTCATTGGAGGGGGTATAGCTAACTTCACCGACGTCGGGGCCACATTTAGCGGCATCATTCGGGCCTTAAGAGAGAAGgtagctatgc ... ttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGTCCAAATTACCAAACTGGGCTGGCTAAAATGCGCAAGCTTGGCGCAGAAC




<











<


<











 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

tccacatgttcatctgattgattgactgtcaactgaatctgaaacttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGTCCAAATTACCAAACTGGGCTGGCTAAAATGCGCAAGCTTGGCGCAGAAC
                   gattgac  putative branch site (score: 86)
                                            cttgctttc  putative PPT
                attgatt  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
gtagctatgctgacccctaaatctagaattgtggccaatgttctctaaaacttatcaccagttccacatgttcatctgattgattgactgtcaactgaatctgaaacttgctttcagGAATCCAAGTTGAAGGCTGCAAGGATGCACATCTATGTCCGACGTGGTGGTCCAAATTACCAAACTGGGCTGGCTAAAATGCGCAAGCTTGGCGCAGAAC

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CAAGCT