1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' |
...ataacttctgttttgatgtatgaagctaatccgtaattagaaatctaaatgaatatacttagcatgtggtttgaatcgtttgtgttgtgtgatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGATACACTGGCAAG
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os10g08550.3 |
intron # | 9 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|58689303|gb|CK077990.1|CK077990
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|58675782|gb|CK064469.1|CK064469
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|117224917|gb|CT845976.1|CT845976
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|29688336|gb|CB684611.1|CB684611
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|319908690|gb|HS977818.1|HS977818
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGNTAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGNEST: gi|33676058|gb|CF304297.1|CF304297
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAG-GAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGG
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|33687081|gb|CF315320.1|CF315320
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|29678862|gb|CB675137.1|CB675137
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|319908492|gb|HS977620.1|HS977620
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|33674962|gb|CF303201.1|CF303201
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|427989|gb|D24135.1|D24135
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTEST: gi|29644081|gb|CB649088.1|CB649088
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCT
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAAGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACCAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAAGCTGGAEST: gi|29665470|gb|CB661745.1|CB661745
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|29679887|gb|CB676162.1|CB676162
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|396941266|gb|HO188475.1|HO188475
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|428358|gb|D24506.1|D24506
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGNEST: gi|23513780|gb|BU673306.1|BU673306
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|29619828|gb|CB624840.1|CB624840
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGNCA-TTGAAAAGGCTGGEST: gi|29657924|gb|CB654199.1|CB654199
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTG-CAATTGAAAAGGCTGG
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|58588647|gb|CF986955.1|CF986955
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAEST: gi|58606067|gb|CK034100.1|CK034100
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGACAAGGCTGGAEST: gi|33676198|gb|CF304437.1|CF304437
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|30228895|gb|CB966786.1|CB966786
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|29668592|gb|CB664867.1|CB664867
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAA GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|29626887|gb|CB631898.1|CB631898
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|29681677|gb|CB677952.1|CB677952
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGATTTGCTCCTAACATTCAC GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAGAAGGCTGGAEST: gi|319908681|gb|HS977809.1|HS977809
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGTTGGAEST: gi|30229421|gb|CB967312.1|CB967312
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|2312016|gb|C28171.1|C28171
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|58673278|gb|CK061964.1|CK061964
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|58683046|gb|CK071733.1|CK071733
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|33676308|gb|CF304547.1|CF304547
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|33685910|gb|CF314149.1|CF314149
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: TTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|29659230|gb|CB655505.1|CB655505
genomic: TTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|14192326|gb|AU184537.1|AU184537
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|29682743|gb|CB679018.1|CB679018
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|29679137|gb|CB675412.1|CB675412
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GCAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|27554031|gb|CA997931.1|CA997931
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAT GAAA-CAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCACTTGAAAAGGCTGGAEST: gi|29678678|gb|CB674953.1|CB674953
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|29623734|gb|CB628745.1|CB628745
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|218504551|gb|FG952364.1|FG952364
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTAGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|33676730|gb|CF304969.1|CF304969
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAA-CAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|29639493|gb|CB644502.1|CB644502
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATEST: gi|88401721|gb|CI591048.1|CI591048
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAAT
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|218483031|gb|FG953128.1|FG953128
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|29629934|gb|CB634943.1|CB634943
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|29667979|gb|CB664254.1|CB664254
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAN GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|58666297|gb|CK054983.1|CK054983
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|29656696|gb|CB652971.1|CB652971
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGEST: gi|58662604|gb|CK051290.1|CK051290
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTG
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|29664966|gb|CB661241.1|CB661241
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|29659075|gb|CB655350.1|CB655350
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|58663601|gb|CK052287.1|CK052287
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTEST: gi|29684326|gb|CB680601.1|CB680601
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACT
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGNCA-TTGAAAAGGCTGGEST: gi|58592547|gb|CF990855.1|CF990855
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTG-CAATTGAAAAGGCTGG
EST: GGTGG-TTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGAEST: gi|319908667|gb|HS977795.1|HS977795
genomic: GGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
EST: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAG GAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
genomic: AGGATGCCACCAATGTTGGTGATGAAGGTGGTTTTGCTCCTAACATTCAGgtacttatgc ... gatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGA
taaatgaatatacttagcatgtggtttgaatcgtttgtgttgtgtgatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGATACACTGGCAAG
atctaaa putative branch site (score: 412)
aatatactta TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| ataacttctgttttgatgtatgaagctaatccgtaattagaaatctaaatgaatatacttagcatgtggtttgaatcgtttgtgttgtgtgatattgcagGAAAACAAGGAGGGTCTTGAGCTCTTGAAGACTGCAATTGAAAAGGCTGGATACACTGGCAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TTGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGAAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGGA