1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
gtgagttgatggttttcccttgttttattggtccctctgataaaaatccagagatgattttggtgctgaagtttccatttcttgatgcagGGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACAGTATGCTATATACCTTATCCTCTGGACGGGAACTATAGAAATAGAAATG
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os02g54510.2 |
intron # | 9 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTACACGGAGGNNNNNNNTTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAAT GGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACAEST: gi|86872733|gb|CI341943.1|CI341943
genomic: TTACACGGAGGAAAAAAATTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAATgtgagttgat ... cttgatgcagGGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACA
EST: TTACACGGAGGNNNNNNNTTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAAT GGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACAEST: gi|29621712|gb|CB626723.1|CB626723
genomic: TTACACGGAGGAAAAAAATTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAATgtgagttgat ... cttgatgcagGGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACA
EST: TTACACGGAGGNNNNNNNTTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTGAT GGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACAEST: gi|88512805|gb|CI440311.1|CI440311
genomic: TTACACGGAGGAAAAAAATTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAATgtgagttgat ... cttgatgcagGGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACA
EST: TTACACGGAGGNNNNNNNTTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAAT GGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACAEST: gi|88374409|gb|CI515893.1|CI515893
genomic: TTACACGGAGGAAAAAAATTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAATgtgagttgat ... cttgatgcagGGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACA
EST: TTACACGGAGGNNNNNNNTTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAAT GGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACAEST: gi|86896552|gb|CI328904.1|CI328904
genomic: TTACACGGAGGAAAAAAATTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAATgtgagttgat ... cttgatgcagGGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACA
EST: TTACACGGAGGNNNNNNNTTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAAT GGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACAEST: gi|88492076|gb|CI429348.1|CI429348
genomic: TTACACGGAGGAAAAAAATTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAATgtgagttgat ... cttgatgcagGGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACA
EST: TTACACGGAGGNNNNNNNTTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAAT GGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACAEST: gi|29677569|gb|CB673844.1|CB673844
genomic: TTACACGGAGGAAAAAAATTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAATgtgagttgat ... cttgatgcagGGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACA
EST: TTACACGGAGGNNNNNNNTTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAAT GGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACAEST: gi|88520199|gb|CI447853.1|CI447853
genomic: TTACACGGAGGAAAAAAATTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAATgtgagttgat ... cttgatgcagGGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACA
EST: TTACACGGAGGNNNNNNNTTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAAT GGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACAEST: gi|29623880|gb|CB628891.1|CB628891
genomic: TTACACGGAGGAAAAAAATTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAATgtgagttgat ... cttgatgcagGGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACA
EST: TTACACGGAGGNNNNNNNTTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTGAT GGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACAEST: gi|86436755|gb|CI118477.1|CI118477
genomic: TTACACGGAGGAAAAAAATTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAATgtgagttgat ... cttgatgcagGGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACA
EST: TTACACGGAGGNNNNNNNTTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAAT GGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACAEST: gi|86852008|gb|CI317768.1|CI317768
genomic: TTACACGGAGGAAAAAAATTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAATgtgagttgat ... cttgatgcagGGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACA
EST: TTTCATCACGGAAGTTCCAGACCAAGTTTAAT GGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACAEST: gi|88435866|gb|CI514005.1|CI514005
genomic: TTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAATgtgagttgat ... cttgatgcagGGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACA
EST: TTACACGGAGGNNNNNNNTTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAAT GGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACAEST: gi|88252274|gb|CI350702.1|CI350702
genomic: TTACACGGAGGAAAAAAATTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAATgtgagttgat ... cttgatgcagGGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACA
EST: TTACACGGAGGNNNNNNNTTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAAT GGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACAEST: gi|88505935|gb|CI433441.1|CI433441
genomic: TTACACGGAGGAAAAAAATTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAATgtgagttgat ... cttgatgcagGGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACA
EST: TTACACGGAGGNNNNNNNTTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAAT GGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACAEST: gi|86841644|gb|CI337351.1|CI337351
genomic: TTACACGGAGGAAAAAAATTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAATgtgagttgat ... cttgatgcagGGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACA
EST: TTACACGGAGGNNNNNNNTTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAAT GGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACAEST: gi|86878737|gb|CI340606.1|CI340606
genomic: TTACACGGAGGAAAAAAATTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAATgtgagttgat ... cttgatgcagGGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACA
EST: TTACACGGAGGNNNNNNNTTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAAT GGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACAEST: gi|86865351|gb|CI330872.1|CI330872
genomic: TTACACGGAGGAAAAAAATTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAATgtgagttgat ... cttgatgcagGGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACA
EST: TTACACGGAGGNNNNNNNTTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAAT GGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACAEST: gi|88488042|gb|CI425313.1|CI425313
genomic: TTACACGGAGGAAAAAAATTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAATgtgagttgat ... cttgatgcagGGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACA
EST: TTACACGGAGGNNNNNNNTTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAAT GGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACAEST: gi|396941216|gb|HO188425.1|HO188425
genomic: TTACACGGAGGAAAAAAATTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAATgtgagttgat ... cttgatgcagGGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACA
EST: TTACACGGAGGNNNNNNNTTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTGAT GGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACAEST: gi|29624045|gb|CB629056.1|CB629056
genomic: TTACACGGAGGAAAAAAATTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAATgtgagttgat ... cttgatgcagGGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACA
EST: TTACACGGAGGNNNNNNNTTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTGAT GGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACAEST: gi|88455418|gb|CI519439.1|CI519439
genomic: TTACACGGAGGAAAAAAATTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAATgtgagttgat ... cttgatgcagGGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACA
EST: TTACACGGAGGNNNNNNNTTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAAT GGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACAEST: gi|88505583|gb|CI433089.1|CI433089
genomic: TTACACGGAGGAAAAAAATTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAATgtgagttgat ... cttgatgcagGGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACA
EST: TTACACGGAGGNNNNNNNTTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAAT GGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACAEST: gi|88509459|gb|CI436965.1|CI436965
genomic: TTACACGGAGGAAAAAAATTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAATgtgagttgat ... cttgatgcagGGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACA
EST: TTACACGGAGGNNNNNNNTTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAAT GGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACAEST: gi|88513637|gb|CI441143.1|CI441143
genomic: TTACACGGAGGAAAAAAATTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAATgtgagttgat ... cttgatgcagGGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACA
EST: TTACACGGAGGNNNNNNNTTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAAT GGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACAEST: gi|88250609|gb|CI348839.1|CI348839
genomic: TTACACGGAGGAAAAAAATTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAATgtgagttgat ... cttgatgcagGGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACA
EST: TTACACGGAGGNNNNNNNTTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAAT GGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACA
genomic: TTACACGGAGGAAAAAAATTTCATCACGGAAGTTCCAGAGCAAGTTTAATgtgagttgat ... cttgatgcagGGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACA
tctgataaaaatccagagatgattttggtgctgaagtttccatttcttgatgcagGGATTTTCGATCCTGGAATCATCAGCTGTCGTTTGCCTTCCTCGGGGAACAGTATGCTATATACCTTATCCTCTGGACGGGAACTATAGAAATAGAAATG
tcttgat putative branch site (score: 24)
tttccatttctt CT-rich tract
taaaaat TA-rich tract