1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
gtacatggtaattcttctggattcaatgtacatgatggctatcaaacacatatttctgacttgatacttgttcgcatacagATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCCATACTGTTCGTGATGAATATGATATGGTTTTCCAAGATCTTAAGGGGCC
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os05g43540.1 |
intron # | 8 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTACATTATGATCAG ATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCCEST: gi|88839208|gb|CI378132.1|CI378132
genomic: TAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTACATTATGATCAGgtacatggta ... tcgcatacagATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCC
EST: TAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTACATTATGATCAG ATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCCEST: gi|88956742|gb|CI009012.1|CI009012
genomic: TAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTACATTATGATCAGgtacatggta ... tcgcatacagATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCC
EST: TAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTACATTATGATCAG ATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCCEST: gi|33691827|gb|CF320066.1|CF320066
genomic: TAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTACATTATGATCAGgtacatggta ... tcgcatacagATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCC
EST: TAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTACATTATGATCAG ATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCCEST: gi|88560412|gb|CI491071.1|CI491071
genomic: TAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTACATTATGATCAGgtacatggta ... tcgcatacagATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCC
EST: TAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTACATTATGATCAG ATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCCEST: gi|88272939|gb|CI386199.1|CI386199
genomic: TAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTACATTATGATCAGgtacatggta ... tcgcatacagATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCC
EST: TAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTACATTATGATCAG ATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCCEST: gi|88296681|gb|CI537648.1|CI537648
genomic: TAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTACATTATGATCAGgtacatggta ... tcgcatacagATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCC
EST: TAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTACATTATGATCAG ATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCCEST: gi|14192050|gb|AU184261.1|AU184261
genomic: TAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTACATTATGATCAGgtacatggta ... tcgcatacagATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCC
EST: TAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTNCATTATGATCAG ATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCCEST: gi|86820908|gb|CI357642.1|CI357642
genomic: TAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTACATTATGATCAGgtacatggta ... tcgcatacagATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCC
EST: TTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTACATTATGATCAG ATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCCEST: gi|88522122|gb|CI449856.1|CI449856
genomic: TTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTACATTATGATCAGgtacatggta ... tcgcatacagATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCC
EST: TAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTACATTATGATCAG ATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCCEST: gi|86853806|gb|CI329252.1|CI329252
genomic: TAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTACATTATGATCAGgtacatggta ... tcgcatacagATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCC
EST: GATCTTTTTACATTATGATCAG ATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCCEST: gi|29666720|gb|CB662995.1|CB662995
genomic: GATCTTTTTACATTATGATCAGgtacatggta ... tcgcatacagATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCC
EST: TAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTACATTATGATCAG ATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCCEST: gi|5667497|gb|AU077739.1|AU077739
genomic: TAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTACATTATGATCAGgtacatggta ... tcgcatacagATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCC
EST: TTTTACATTATNATCAG ATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCCEST: gi|86860123|gb|CI322021.1|CI322021
genomic: TTTTACATTATGATCAGgtacatggta ... tcgcatacagATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCC
EST: TTTGGTCATGTACTTG-TTTATCAGATCTTTTTACATTATGATCAG ATTAAGCAGATGGAAACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCC
genomic: TTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTACATTATGATCAGgtacatggta ... tcgcatacagATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCC
tgtacatgatggctatcaaacacatatttctgacttgatacttgttcgcatacagATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCCATACTGTTCGTGATGAATATGATATGGTTTTCCAAGATCTTAAGGGGCC
cttgttc CT-rich tract
acatattt TA-rich tract