1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' |
gttagttcattatctagtaattttccaatatacatggaactactcttttgaatatgtgatatgtattcttgtttggcaaaaatttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATGTGTTCAGTTTGTGAGATGGCTGTTGTGTGGATAGAGAACCAGCTACGC
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os05g04630.3 |
intron # | 8 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|218480797|gb|FG967575.1|FG967575
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29665938|gb|CB662213.1|CB662213
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACATGGGTTGTGATGCTATEST: gi|29622575|gb|CB627586.1|CB627586
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|218495527|gb|FG960510.1|FG960510
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29667625|gb|CB663900.1|CB663900
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|218501520|gb|FG954804.1|FG954804
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|30226990|gb|CB964882.1|CB964882
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATG-TTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29639324|gb|CB644333.1|CB644333
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|218504598|gb|FG967437.1|FG967437
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|218486904|gb|FG965174.1|FG965174
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|8251030|gb|AU091273.1|AU091273
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTG-GNATGTTTGNCGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29687636|gb|CB683911.1|CB683911
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|8251118|gb|AU091480.1|AU091480
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: TATGCAGCCCAGNTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29676405|gb|CB672680.1|CB672680
genomic: TATGCAG-CCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29646768|gb|CB651775.1|CB651775
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29622059|gb|CB627070.1|CB627070
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29616094|gb|CB621106.1|CB621106
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29642217|gb|CB647224.1|CB647224
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29626756|gb|CB631767.1|CB631767
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: AGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29676558|gb|CB672833.1|CB672833
genomic: AGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29624410|gb|CB629421.1|CB629421
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29680750|gb|CB677025.1|CB677025
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29678515|gb|CB674790.1|CB674790
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29616175|gb|CB621187.1|CB621187
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29626867|gb|CB631878.1|CB631878
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29676213|gb|CB672488.1|CB672488
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|58695321|gb|CK084008.1|CK084008
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29628164|gb|CB633175.1|CB633175
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|218491254|gb|FG966852.1|FG966852
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|58695903|gb|CK084590.1|CK084590
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29633123|gb|CB638132.1|CB638132
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: CGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|218487267|gb|FG944918.1|FG944918
genomic: CGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACEST: gi|29665939|gb|CB662214.1|CB662214
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGAC
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTACEST: gi|87012926|gb|CI297153.1|CI297153
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|33680485|gb|CF308724.1|CF308724
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29616329|gb|CB621341.1|CB621341
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29622577|gb|CB627588.1|CB627588
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29630526|gb|CB635535.1|CB635535
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|58592698|gb|CF991006.1|CF991006
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: TATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGAGCGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29629202|gb|CB634213.1|CB634213
genomic: TATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGA-CGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29680078|gb|CB676353.1|CB676353
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29678523|gb|CB674798.1|CB674798
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29626868|gb|CB631879.1|CB631879
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|218498507|gb|FG959135.1|FG959135
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: CGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|218501876|gb|FG958335.1|FG958335
genomic: CGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGACTCTGTTGTCGACAAAEST: gi|8251276|gb|AU091474.1|AU091474
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAA
EST: GTATGCAGCCAGNTTGGTCTGTGTATGTTTTACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|33793469|gb|CF322617.1|CF322617
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAA-CTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29678524|gb|CB674799.1|CB674799
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29639464|gb|CB644473.1|CB644473
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29622720|gb|CB627731.1|CB627731
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29615432|gb|CB620444.1|CB620444
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|33684584|gb|CF312823.1|CF312823
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29615279|gb|CB620291.1|CB620291
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29628864|gb|CB633875.1|CB633875
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|33654352|gb|CF276966.1|CF276966
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29678429|gb|CB674704.1|CB674704
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|38565650|gb|CK085103.1|CK085103
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATEST: gi|29628863|gb|CB633874.1|CB633874
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
EST: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAG CAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
genomic: GTATGCAGCCAGGTTGGTCTGTGTATGTTTGACGGTAAACGCTCAGTAAGgttagttcat ... atttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTAT
gaactactcttttgaatatgtgatatgtattcttgtttggcaaaaatttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATGTGTTCAGTTTGTGAGATGGCTGTTGTGTGGATAGAGAACCAGCTACGC
tttctgc CT-rich tract
ttttgaatat TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| gttagttcattatctagtaattttccaatatacatggaactactcttttgaatatgtgatatgtattcttgtttggcaaaaatttctgcagCAATGGGATTGAATCTGTTGTCGACAAAGAAAACTTGGGTTCTGATGCTATGTGTTCAGTTTGTGAGATGGCTGTTGTGTGGATAGAGAACCAGCTACGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGATG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGTT