1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' |
gtatgcacatctaacaagttgcccaatttgtcagttttatcgtgttttttgttagtgagcgtcctaagttctatgtaatccaactagggatcatattgccagcaactaacaatgtgtatgcctttatatccacctgctttctagGTATCTTGCACATGGCACCACAACTGATTACATGTACGACATTGTAAAGGTGCCTATGCCCTTTACCTTTGAG
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os02g02710.1 |
intron # | 8 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CGCCATTTCCAAGATAGCTGCCTTGTTGGATCAGGTGGTGGAGCTGTGGG GTATCTTGCACATGGCACCACAACTGATTACATGTACGACATTGTAAAGGTEST: gi|58685947|gb|CK074634.1|CK074634
genomic: CGCCATTTCCAAGATAGCTGCCTTGTTGGATCAGGTGGTGGAGCTGTGGGgtatgcacat ... tgctttctagGTATCTTGCACATGGCACCACAACTGATTACATGTACGACATTGTAAAGGT
EST: CGCCATTTCCAAGATAGCTGCCTTGTTGGATCAGGTGGTGGAGCTGTGGG GTATCTTGCACATGGCACCACAACTGATTACATGTACGACATTGTAAAGGT
genomic: CGCCATTTCCAAGATAGCTGCCTTGTTGGATCAGGTGGTGGAGCTGTGGGgtatgcacat ... tgctttctagGTATCTTGCACATGGCACCACAACTGATTACATGTACGACATTGTAAAGGT
atcatattgccagcaactaacaatgtgtatgcctttatatccacctgctttctagGTATCTTGCACATGGCACCACAACTGATTACATGTACGACATTGTAAAGGTGCCTATGCCCTTTACCTTTGAG
aactaac putative branch site (score: 1)
tccacctgctttct putative PPT
tttatat TA-rich tract