1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' |
gtatgtacctccccaatatgattatgatttatgaacttgcccccacatattctaccagaaagtactaaggagctttaaaatttactgctacagGGTTCATCGCAATGTATGCTACTCTGGCTAGTCGCGATGTG
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os01g09570.1 |
intron # | 7 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GAGTGCAGAGAATGGCATTGGTGTTGTGAAACTAATGGGGCGCAACAGTG GGTTCATCGCAATGTATGCTACTCTGGCTAGTCGCGATGTGEST: gi|38478521|gb|CF962654.1|CF962654
genomic: GAGTGCAGAGAATGGCATTGGTGTTGTGAAACTAATGGGGCGCAACAGTGgtatgtacct ... actgctacagGGTTCATCGCAATGTATGCTACTCTGGCTAGTCGCGATGTG
EST: GTGCAGAGAATGGCATTGGTGTTGTGAAACTAATGGGGCGCAAGGC-GTG GGTTCATCGCAATGTATGCTACTCTGGCTAGTCGCGATGTGEST: gi|58689720|gb|CK078407.1|CK078407
genomic: GTGCAGAGAATGGCATTGGTGTTGTGAAACTAATGGGGCGCAA--CAGTGgtatgtacct ... actgctacagGGTTCATCGCAATGTATGCTACTCTGGCTAGTCGCGATGTG
EST: GAGTGCAGAGAATGGCATTGGTGTTGTGAAACTAATGGGGCGCAACAGTG GGTTCATCGCAATGTATGCTACTCTGGCTAGTCGCGATGTGEST: gi|33675777|gb|CF304016.1|CF304016
genomic: GAGTGCAGAGAATGGCATTGGTGTTGTGAAACTAATGGGGCGCAACAGTGgtatgtacct ... actgctacagGGTTCATCGCAATGTATGCTACTCTGGCTAGTCGCGATGTG
EST: GAGTGCAGAGAATGGCATTGGTGTTGTGAAACTAATGGGGCGCAACAGTG GGTTCATCGCAATGTATGCTACTCTGGCTAGTCGCGATGTGEST: gi|568982|gb|D39831.1|D39831
genomic: GAGTGCAGAGAATGGCATTGGTGTTGTGAAACTAATGGGGCGCAACAGTGgtatgtacct ... actgctacagGGTTCATCGCAATGTATGCTACTCTGGCTAGTCGCGATGTG
EST: GAGTGCAGAGAATGGCATTGGTGTTGTG-AACTAATGGGGCGCAACAGTG GGTTCATCGCAATGTATGCTACTCTGGCTAGTCGCGATGTGEST: gi|33674975|gb|CF303214.1|CF303214
genomic: GAGTGCAGAGAATGGCATTGGTGTTGTGAAACTAATGGGGCGCAACAGTGgtatgtacct ... actgctacagGGTTCATCGCAATGTATGCTACTCTGGCTAGTCGCGATGTG
EST: GAGTGCAGAGAATGGCATTGGTGTTGTGAAACTAATGGGGCGCAACAGTG GGTTCATCGCAATGTATGCTACTCTGGCTAGTCGCGATGTG
genomic: GAGTGCAGAGAATGGCATTGGTGTTGTGAAACTAATGGGGCGCAACAGTGgtatgtacct ... actgctacagGGTTCATCGCAATGTATGCTACTCTGGCTAGTCGCGATGTG
gcccccacatattctaccagaaagtactaaggagctttaaaatttactgctacagGGTTCATCGCAATGTATGCTACTCTGGCTAGTCGCGATGTG
tttaaaatttact TA-rich tract