1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' |
gtatgtgcagataagtagatggttttcactttgactttgctgtcttagcatttctttgttatctcactttgttgttgttaaccttccagGACACTTTCCGTGGTAGAGTGTGTGAATGCCCTACATTCAATGGTGTGCAGTTTAAAGGCGATGGCTACAGCAATTGTGAAC
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os10g20630.1 |
intron # | 6 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ACGGGGGTTGCTGGCAAGACAAAGCTGCTAATGTAACAGCTTGCAGG GACACTTTCCGTGGTAGAGTGTGTGAATGCCCTACATTCAATGGTGTGCAGEST: gi|58594426|gb|CF992734.1|CF992734
genomic: ACGGGGGTTGCTGGCAAGACAAAGCTGCTAATGTAACAGCTTGCAGGgtatgtgcag ... aaccttccagGACACTTTCCGTGGTAGAGTGTGTGAATGCCCTACATTCAATGGTGTGCAG
EST: ACAACGGGGGTTGCTGGCAAGACAAAGCTGCTAATGTAACAGCTTGCAGG GACACTTTCCGTGGTAGAGTGTGTGAATGCCCTACATTCAATGGTGTGCAGEST: gi|33692858|gb|CF321097.1|CF321097
genomic: ACAACGGGGGTTGCTGGCAAGACAAAGCTGCTAATGTAACAGCTTGCAGGgtatgtgcag ... aaccttccagGACACTTTCCGTGGTAGAGTGTGTGAATGCCCTACATTCAATGGTGTGCAG
EST: ACAACGGGGGTTGCTGGCAAGACAAAGCTGCTAATGTAACAGCTTGCAGG GACACTTTCCGTGGTAGAGTGTGTGAATGCCCTACATTCAATGGTGTGCAGEST: gi|33796525|gb|CF324129.1|CF324129
genomic: ACAACGGGGGTTGCTGGCAAGACAAAGCTGCTAATGTAACAGCTTGCAGGgtatgtgcag ... aaccttccagGACACTTTCCGTGGTAGAGTGTGTGAATGCCCTACATTCAATGGTGTGCAG
EST: ACAACGGGGGTTGCTGGCAAGACAAAGCTGCTAATGTAACAGCTTGCAGG GACACTTTCCGTGGTAGAGTGTGTGAATGCCCTACATTCAATGGTGTGCAGEST: gi|300215523|gb|HO088149.1|HO088149
genomic: ACAACGGGGGTTGCTGGCAAGACAAAGCTGCTAATGTAACAGCTTGCAGGgtatgtgcag ... aaccttccagGACACTTTCCGTGGTAGAGTGTGTGAATGCCCTACATTCAATGGTGTGCAG
EST: ACAACGGGGGTTGCTGGCAAGACAAAGCTGCTAATGTAACAGCTTGCAGG GACACTTTCCGTGGTAGAGTGTGTGAATGCCCTACATTCAATGGTGTGCAGEST: gi|29674931|gb|CB671206.1|CB671206
genomic: ACAACGGGGGTTGCTGGCAAGACAAAGCTGCTAATGTAACAGCTTGCAGGgtatgtgcag ... aaccttccagGACACTTTCCGTGGTAGAGTGTGTGAATGCCCTACATTCAATGGTGTGCAG
EST: ACAACGGGGGTTGCTGGCAAGACAAAGCTGCTAATGTAACAGCTTGCAGG GACACTTTCCGTGGTAGAGTGTGTGAATGCCCTACATTCAATGGTGTGCAG
genomic: ACAACGGGGGTTGCTGGCAAGACAAAGCTGCTAATGTAACAGCTTGCAGGgtatgtgcag ... aaccttccagGACACTTTCCGTGGTAGAGTGTGTGAATGCCCTACATTCAATGGTGTGCAG
ctttgctgtcttagcatttctttgttatctcactttgttgttgttaaccttccagGACACTTTCCGTGGTAGAGTGTGTGAATGCCCTACATTCAATGGTGTGCAGTTTAAAGGCGATGGCTACAGCAATTGTGAAC
tgttaac putative branch site (score: 39)
ccttcc CT-rich tract
atttcttt TA-rich tract