Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gttagataacaaagtcactcctatgtggaactttgtcatatttatggattctcttgattgtgctttgttgtcttggagttttatgatttttttttcatgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTAATCCCACAATG

Basic information

species Oryza sativa
transcript LOC_Os09g32220.1
intron # 6
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: LOC_Os09g32220.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 6
lower sequence: GRMZM2G014313_T02 (Zea mays), 3'ss of exon 6
gttagataacaaag-tcactcctatgtggaactttgtcatatttatggat----tctcttgattgtgctttgttgtcttggagttttatgatttttttttcatgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTAATCCCACAATG
      ||   | | ||||    |  ||   || ||  | | || |   |    | | ||||   |  |   ||| || ||||||| || || |||   |    |  |||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||||
-----gtactgatgctcaccttgacatgt--ctctgcaaaacttgtcagtagcatttattgaccattttgcattgcctgggagtttgattatctttgcctgt--atgtgcagCAACTGATGATGCACAGAAGATGATGCAAATGGGTGGTGGATTTGGATTTAACCCAACAATG
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|88834677|gb|CI077960.1|CI077960
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|86511384|gb|CI154017.1|CI154017
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|89195920|gb|CI007339.1|CI007339
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|86525680|gb|CI165886.1|CI165886
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|66920739|gb|CX107587.1|CX107587
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|86834746|gb|CI340863.1|CI340863
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|88525714|gb|CI452740.1|CI452740
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|88206181|gb|CI206030.1|CI206030
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|88214287|gb|CI214136.1|CI214136
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|88255123|gb|CI353947.1|CI353947
EST:     TTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|87032311|gb|CI264092.1|CI264092
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|88527605|gb|CI455778.1|CI455778
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|87017018|gb|CI286154.1|CI286154
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|25806351|gb|CA762312.1|CA762312
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTTTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCCCAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|86523056|gb|CI163262.1|CI163262
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|4716728|gb|AU057844.1|AU057844
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|88852557|gb|CI374325.1|CI374325
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|86528191|gb|CI168397.1|CI168397
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|86506491|gb|CI149124.1|CI149124
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|86854905|gb|CI260973.1|CI260973
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|86545313|gb|CI185519.1|CI185519
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACTAAAGATGATGCAGATGGTTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|86836282|gb|CI348237.1|CI348237
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|88829310|gb|CI074180.1|CI074180
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|86543296|gb|CI183502.1|CI183502
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|88270574|gb|CI385832.1|CI385832
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGTTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|88535695|gb|CI462510.1|CI462510
EST:     TGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|88530593|gb|CI458999.1|CI458999
EST:     GGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: GGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|117242276|gb|CT842928.1|CT842928
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGAT
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGAT
EST: gi|86417257|gb|CI031466.1|CI031466
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|86523141|gb|CI163347.1|CI163347
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|88215049|gb|CI214898.1|CI214898
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|13895966|gb|AU182302.1|AU182302
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|88252682|gb|CI351110.1|CI351110
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATCCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|33665107|gb|CF296074.1|CF296074
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|88901768|gb|CI374376.1|CI374376
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCACTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGTTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|33688253|gb|CF316492.1|CF316492
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
EST: gi|86251662|gb|CI016951.1|CI016951
EST:     TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATG                         CTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA
genomic: TTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTA

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 1 RNA-Seqlibrary.


Block sizes: 62 (upstream exon), 62 (downstream exon)
Score: 91

GTACTTTCTCAATTTGTTTGGTTTGAGGGGTCTCTTCAGTCTGATCCTCGGTGAAGAAAATGgttagataac ... tgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTAATCCCACAATG




<











<


<











 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

cttgattgtgctttgttgtcttggagttttatgatttttttttcatgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTAATCCCACAATG
 tcttgat  putative branch site (score: 91)
                                  tttttttttcat  putative PPT
                        agttttatgatttttt  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
gttagataacaaagtcactcctatgtggaactttgtcatatttatggattctcttgattgtgctttgttgtcttggagttttatgatttttttttcatgacctgcagCTAATGATGATGCACAAAAGATGATGCAGATGGGTGGGGGATTTGGCGGTAATCCCACAATG

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGATG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCAGAT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  CAGATG