1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
gtatgagcattgctgtgttcaatttatatgttcttttcctgtatccacagtccctgccagtcttctttatactttatctaatgctcgtatttaaaactaccaatagGCCGCTTGATCTTTGTGATGCAATGACTCCAAACCCGGATGCACTTTCTATTGGTTACTCGGGATCTCATGCAAGTGGTTTAATGCTTCCAAACCATCCC
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os08g08000.1 |
intron # | 6 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TCTCATCTTCATGCACTNTCTCAAGCATGTGCACCTGGAGTCATTTTGAT GCCGCTTGATCTTTGTGATGCAATGACTEST: gi|29644348|gb|CB649355.1|CB649355
genomic: TCTCATCTTCATGCACTTTCTCAAGCATGTGCACCTGGAGTCATTTTGATgtatgagcat ... ctaccaatagGCCGCTTGATCTTTGTGATGCAATGACT
EST: TCTCATCTTCATGCACTTTCTCAAGCATGTGCACCTGGAGTCATTTTGAT GCCGCTTGATCTTTGTGATGCAATGACTCCAAACCCGGATGCACTTTCTATEST: gi|58654091|gb|CK042771.1|CK042771
genomic: TCTCATCTTCATGCACTTTCTCAAGCATGTGCACCTGGAGTCATTTTGATgtatgagcat ... ctaccaatagGCCGCTTGATCTTTGTGATGCAATGACTCCAAACCCGGATGCACTTTCTAT
EST: TCTCATCTTCATGCACTTTCTCAAGCATGTGCACCTGGAGTCATTTTGAT GCCGCTTGATCTTTGTGATGCAATGACTCCAAACCCGGATGCACTTTCTAT
genomic: TCTCATCTTCATGCACTTTCTCAAGCATGTGCACCTGGAGTCATTTTGATgtatgagcat ... ctaccaatagGCCGCTTGATCTTTGTGATGCAATGACTCCAAACCCGGATGCACTTTCTAT
ccctgccagtcttctttatactttatctaatgctcgtatttaaaactaccaatagGCCGCTTGATCTTTGTGATGCAATGACTCCAAACCCGGATGCACTTTCTATTGGTTACTCGGGATCTCATGCAAGTGGTTTAATGCTTCCAAACCATCCC
atctaat putative branch site (score: 19)
tttatactttatctaa TA-rich tract