1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
...tgtgcaattgcatctttagttatttgaagctttgtaatgtgagggtattgaatgcatattgtgctttaacaatttaagctttgcccaccaatcccgacagGTCAATATTCCACGTGATCTAATGGTAAAACAATACCCCCACTTCATGGACCGCAGTCCTTCGTACCATTCGTCGTCCATACTTGGAAAAATCTATGATA
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os01g10140.3 |
intron # | 6 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GCTTTGGATGCTCCAAAGATGGGGAACAA- GTCAATATTCCACGTGATCTAATGGTAAAACAATACCCCCACTTCATGGACEST: gi|2311470|gb|C27625.1|C27625
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EST: TAGTTGACCTTTATTATTTGGCTTTGGATGCTCCAAAGATGGGGAACAAG GTCAATATTCCACGTGATCTAATGGTAAAACAATACCCCCACTTCATGGACEST: gi|88363324|gb|CI643182.1|CI643182
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genomic: TAGTTGACCTTTATTATTTGGCTTTGGATGCTCCAAAGATGGGGAACAAGgttaacttca ... atcccgacagGTCAATATTCCACGTGATCTAATGGTAAAACAATACCCCCACTTCATG
tattgaatgcatattgtgctttaacaatttaagctttgcccaccaatcccgacagGTCAATATTCCACGTGATCTAATGGTAAAACAATACCCCCACTTCATGGACCGCAGTCCTTCGTACCATTCGTCGTCCATACTTGGAAAAATCTATGATA
ctttaac putative branch site (score: 2)
tttaacaatttaa TA-rich tract