1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
...catgatttttgggcaactacttgcaattcatggttcacaacttagatgtatgaggctgctaaatagtaatctggaatttcctattgctggccatctgcagGTCATGCACTTAATTGGTGATGTGAAGGGTAAGGTCGCCATCATGGTTGATGATATGATAGACACAGCAG
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os06g41360.4 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GTTGATAAGAGAAGACAGGGTCACAACATGTCAGAG GTCATGCACTTAATTGGTGATGTGAAGGGTAAGGTCGCCATCATGGTTGATEST: gi|5005492|gb|AU070257.1|AU070257
genomic: GTTGATAAGAGAAGACAGGGTCACAACATGTCAGAGgttggaacaa ... ccatctgcagGTCATGCACTTAATTGGTGATGTGAAGGGTAAGGTCGCCATCATGGTTGAT
EST: CCCCTTTAGCTATCGTTGATAAGAGAAGACAGGGTCACAACATGTCAGAG GTCATGCACTTAATTGGTGATGTGAAGGGTAAGGTCGCCATCATGGTTGAT
genomic: CCCCTTTAGCTATCGTTGATAAGAGAAGACAGGGTCACAACATGTCAGAGgttggaacaa ... ccatctgcagGTCATGCACTTAATTGGTGATGTGAAGGGTAAGGTCGCCATCATGGTTGAT
atgtatgaggctgctaaatagtaatctggaatttcctattgctggccatctgcagGTCATGCACTTAATTGGTGATGTGAAGGGTAAGGTCGCCATCATGGTTGATGATATGATAGACACAGCAG
tgctaaa putative branch site (score: 12)
taaatagtaat TA-rich tract