1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
gtttgtgcaaaacagaaacatttaaagtattttctgcttgaaccaataaacttctctatgccacctatatttatgtgttggtctatttaatgcagCTCTCTGGGCCAAAACCTTAAGACAAGCACTTATGCATGGGAGAATCTGTTTGCAGTTTTTGTCTCAATATCAGGCTTGGTTCTGTTTGCACTGCTAATT
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os06g33570.1 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTTTTGGCAAAACTATTCTATTGTGTTTGGTGGGGTCTGCAAAATCTTAG CTCTCTGGGCCAAAACCTTAAGACAAGCACTTATGCATGGGAGAATCTGTTEST: gi|29666671|gb|CB662946.1|CB662946
genomic: TTTTTGGCAAAACTATTCTATTGTGTTTGGTGGGGTCTGCAAAATCTTAGgtttgtgcaa ... tttaatgcagCTCTCTGGGCCAAAACCTTAAGACAAGCACTTATGCATGGGAGAATCTGTT
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aaccaataaacttctctatgccacctatatttatgtgttggtctatttaatgcagCTCTCTGGGCCAAAACCTTAAGACAAGCACTTATGCATGGGAGAATCTGTTTGCAGTTTTTGTCTCAATATCAGGCTTGGTTCTGTTTGCACTGCTAATT
atttaat putative branch site (score: 23)
tctattt CT-rich tract
tatatttatgtgtt TA-rich tract